More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1576 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1576  NADH dehydrogenase subunit E  100 
 
 
294 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.685824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1600  NADH dehydrogenase subunit E  100 
 
 
294 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.737975  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1546  NADH dehydrogenase subunit E  97.96 
 
 
294 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67963  normal  0.132733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4485  NADH dehydrogenase subunit E  70.25 
 
 
287 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256998  hitchhiker  0.00514085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1881  NADH dehydrogenase subunit E  74.79 
 
 
253 aa  361  9e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.54783 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13170  NADH dehydrogenase subunit E  68.46 
 
 
252 aa  321  7e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  62.61 
 
 
248 aa  276  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.941311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3172  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  65.68 
 
 
237 aa  271  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0285  NADH-quinone oxidoreductase subunit E  60.63 
 
 
231 aa  270  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07420  NADH dehydrogenase subunit E  60.94 
 
 
319 aa  270  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0368218 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3225  NADH dehydrogenase subunit E  62.22 
 
 
283 aa  269  4e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0065484 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  61.99 
 
 
294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2691  NADH dehydrogenase subunit E  58.48 
 
 
239 aa  265  5e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0271  NADH dehydrogenase subunit E  65.88 
 
 
269 aa  265  5e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0588  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit- like protein  58.18 
 
 
219 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0473  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  61.19 
 
 
302 aa  261  6.999999999999999e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.17 
 
 
706 aa  257  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4414  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  55.6 
 
 
240 aa  256  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0543  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  56.13 
 
 
269 aa  245  6.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7687  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  60 
 
 
228 aa  232  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0524  NADH dehydrogenase subunit E  51.81 
 
 
263 aa  232  7.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1278  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  55.45 
 
 
230 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.468909 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0542  NADH dehydrogenase subunit E  54.75 
 
 
262 aa  227  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.542965  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4459  NADH dehydrogenase subunit E  55.98 
 
 
305 aa  225  7e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4061  NADH dehydrogenase subunit E  56.46 
 
 
317 aa  224  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732889  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  53.3 
 
 
273 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03200  NADH dehydrogenase subunit E  51.63 
 
 
253 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4554  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  55.87 
 
 
341 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0978  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  54.11 
 
 
249 aa  212  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6678  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  53.27 
 
 
254 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0367  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.06 
 
 
208 aa  132  6e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  35.91 
 
 
239 aa  112  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  33.99 
 
 
166 aa  111  1.0000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  37.89 
 
 
208 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1312  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.67 
 
 
160 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.59 
 
 
170 aa  109  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.33 
 
 
165 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.95 
 
 
170 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  37.33 
 
 
270 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.9 
 
 
161 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  37.09 
 
 
180 aa  101  1e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0913  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.02 
 
 
203 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.82 
 
 
174 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0482  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.69 
 
 
162 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.220464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4349  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.71 
 
 
188 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  36.6 
 
 
181 aa  99.8  5e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2809  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.41 
 
 
165 aa  99.4  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  35.1 
 
 
181 aa  98.6  1e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1267  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.24 
 
 
175 aa  98.2  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.67 
 
 
176 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.99 
 
 
163 aa  98.2  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.99 
 
 
163 aa  98.2  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1873  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  37.09 
 
 
188 aa  96.7  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.22 
 
 
412 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1279  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.42 
 
 
183 aa  95.9  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.33 
 
 
385 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.84 
 
 
174 aa  95.9  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2156  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.36 
 
 
224 aa  95.9  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4394  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.21 
 
 
394 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0721  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.88 
 
 
157 aa  95.1  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000389921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0961  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.35 
 
 
163 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643352 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0697  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.88 
 
 
157 aa  95.1  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000280605  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0876  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.35 
 
 
163 aa  95.1  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  31.71 
 
 
249 aa  94  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1210  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.59 
 
 
412 aa  94  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2922  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.64 
 
 
264 aa  94  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1081  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.59 
 
 
412 aa  94  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.320932 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4629  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.12 
 
 
229 aa  93.2  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  33.95 
 
 
260 aa  93.2  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1045  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.67 
 
 
230 aa  92.8  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1153  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  38.31 
 
 
212 aa  92.8  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5176  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.06 
 
 
163 aa  92.8  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  35.9 
 
 
174 aa  92.4  7e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  35.9 
 
 
174 aa  92.4  7e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2986  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.27 
 
 
229 aa  92.4  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0736686  normal  0.383268 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  35.14 
 
 
175 aa  91.3  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06310  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  29.03 
 
 
162 aa  91.3  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000454733  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0990  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.93 
 
 
168 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504399  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1924  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.73 
 
 
172 aa  90.5  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.362282  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3252  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.09 
 
 
166 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2703  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  34.48 
 
 
151 aa  90.1  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3222  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  31.4 
 
 
208 aa  89.7  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.237944  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  40.94 
 
 
158 aa  89.7  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3083  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.94 
 
 
174 aa  89.7  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4355  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.54 
 
 
171 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.54 
 
 
171 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4200  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.54 
 
 
171 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.64 
 
 
166 aa  88.2  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0893  NADH dehydrogenase subunit E  33.33 
 
 
273 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58748  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1428  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.36 
 
 
165 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.464968  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0746  NADH dehydrogenase subunit E  30.97 
 
 
398 aa  88.6  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.331264  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2056  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.55 
 
 
457 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2236  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.07 
 
 
163 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1016  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.36 
 
 
168 aa  87.8  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.664946  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2058  NADH dehydrogenase subunit E  35.12 
 
 
167 aa  87  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174503  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3506  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.68 
 
 
182 aa  87  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1887  NADH dehydrogenase subunit E  35.09 
 
 
167 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  0.768651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2210  NADH dehydrogenase subunit E  35.09 
 
 
167 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.445986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3860  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  34.34 
 
 
159 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.64 
 
 
166 aa  87.4  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0931539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>