More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1278 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1278  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  100 
 
 
230 aa  477  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.468909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4459  NADH dehydrogenase subunit E  61.67 
 
 
305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4061  NADH dehydrogenase subunit E  61.88 
 
 
317 aa  301  8.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732889  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  61.06 
 
 
273 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0542  NADH dehydrogenase subunit E  58.88 
 
 
262 aa  279  3e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.542965  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4554  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  61.01 
 
 
341 aa  266  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4414  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  59.28 
 
 
240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0473  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  57.75 
 
 
302 aa  246  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0588  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit- like protein  56.76 
 
 
219 aa  244  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  58.29 
 
 
294 aa  243  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0285  NADH-quinone oxidoreductase subunit E  56.82 
 
 
231 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6678  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  55.81 
 
 
254 aa  241  6e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13170  NADH dehydrogenase subunit E  56.52 
 
 
252 aa  239  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  56.94 
 
 
248 aa  239  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.941311 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03200  NADH dehydrogenase subunit E  53.33 
 
 
253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07420  NADH dehydrogenase subunit E  56.46 
 
 
319 aa  236  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0368218 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2691  NADH dehydrogenase subunit E  54.67 
 
 
239 aa  234  7e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1881  NADH dehydrogenase subunit E  54.25 
 
 
253 aa  233  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.54783 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0271  NADH dehydrogenase subunit E  52.78 
 
 
269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1546  NADH dehydrogenase subunit E  55.25 
 
 
294 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67963  normal  0.132733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0978  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  51.79 
 
 
249 aa  228  8e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1576  NADH dehydrogenase subunit E  55.45 
 
 
294 aa  228  8e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.685824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1600  NADH dehydrogenase subunit E  55.45 
 
 
294 aa  228  8e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.737975  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4485  NADH dehydrogenase subunit E  52.78 
 
 
287 aa  226  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256998  hitchhiker  0.00514085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0524  NADH dehydrogenase subunit E  54.84 
 
 
263 aa  226  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3225  NADH dehydrogenase subunit E  54.72 
 
 
283 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0065484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7687  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  59.32 
 
 
228 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0543  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  54.85 
 
 
269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3172  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  55.21 
 
 
237 aa  210  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.71 
 
 
706 aa  204  9e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0367  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.3 
 
 
208 aa  141  8e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.1 
 
 
165 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  34.62 
 
 
166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  35.37 
 
 
208 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  34.07 
 
 
239 aa  120  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.08 
 
 
170 aa  120  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 
249 aa  118  7.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.84 
 
 
170 aa  117  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.39 
 
 
161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.55 
 
 
166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  33.94 
 
 
181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4349  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.29 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.54 
 
 
385 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3083  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.01 
 
 
174 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1312  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.54 
 
 
160 aa  112  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  32.93 
 
 
180 aa  112  6e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1267  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.61 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.238783 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  34.39 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  40.65 
 
 
158 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0961  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.58 
 
 
163 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643352 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0876  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.58 
 
 
163 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1242  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.54 
 
 
176 aa  109  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1887  NADH dehydrogenase subunit E  40.5 
 
 
167 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  0.768651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1081  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.76 
 
 
412 aa  109  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.320932 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5176  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.73 
 
 
163 aa  108  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2210  NADH dehydrogenase subunit E  40.5 
 
 
167 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.445986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2156  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.42 
 
 
224 aa  109  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1210  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.76 
 
 
412 aa  109  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2246  NADH dehydrogenase subunit E  30.32 
 
 
239 aa  108  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0214593  normal  0.111261 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3222  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.93 
 
 
208 aa  108  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.237944  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_7050  predicted protein  33.14 
 
 
217 aa  108  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000378621  hitchhiker  0.000000494703 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.77 
 
 
171 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4200  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.77 
 
 
171 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4355  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.77 
 
 
171 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2058  NADH dehydrogenase subunit E  39.67 
 
 
167 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174503  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  38.16 
 
 
193 aa  108  8.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.945573 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1045  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.03 
 
 
230 aa  108  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0913  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.82 
 
 
203 aa  108  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  31.06 
 
 
260 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1295  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  39.73 
 
 
160 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.54 
 
 
412 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.96 
 
 
174 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2003  NADH dehydrogenase subunit E  29.7 
 
 
303 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277346  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3252  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.81 
 
 
166 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2809  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.2 
 
 
165 aa  106  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.86 
 
 
176 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  31.65 
 
 
181 aa  106  4e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.96 
 
 
174 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.48 
 
 
166 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1176  NADH dehydrogenase subunit E  29.09 
 
 
395 aa  105  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1428  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.48 
 
 
165 aa  105  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.464968  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  34.19 
 
 
175 aa  105  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1178  NADH dehydrogenase subunit E  29.09 
 
 
303 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2516  NADH dehydrogenase subunit E  29.09 
 
 
303 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1313  NADH dehydrogenase subunit E  27.8 
 
 
402 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0324148  normal  0.032376 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2922  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.32 
 
 
264 aa  104  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4394  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.36 
 
 
394 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1151  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  39.44 
 
 
154 aa  103  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.995235  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06310  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  30.26 
 
 
162 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000454733  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1873  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  33.95 
 
 
188 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1746  NADH dehydrogenase subunit E  37.96 
 
 
159 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0992  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.31 
 
 
161 aa  103  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2986  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.91 
 
 
229 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0736686  normal  0.383268 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  33.14 
 
 
174 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1497  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.84 
 
 
162 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.358345  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1247  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  32.03 
 
 
158 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0560002  normal  0.0336661 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  33.14 
 
 
174 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0697  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.95 
 
 
157 aa  102  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000280605  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0965  NADH dehydrogenase subunit E  38.02 
 
 
168 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489365  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2831  NADH dehydrogenase subunit E  30.3 
 
 
228 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147014  normal  0.209682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>