More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4554 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4554  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  100 
 
 
341 aa  674    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1278  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  62.33 
 
 
230 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.468909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  62.17 
 
 
273 aa  268  7e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03200  NADH dehydrogenase subunit E  58.4 
 
 
253 aa  266  5e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4459  NADH dehydrogenase subunit E  60.18 
 
 
305 aa  259  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4061  NADH dehydrogenase subunit E  59.73 
 
 
317 aa  256  6e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732889  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6678  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  60.81 
 
 
254 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0271  NADH dehydrogenase subunit E  59.17 
 
 
269 aa  251  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0542  NADH dehydrogenase subunit E  61.03 
 
 
262 aa  248  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.542965  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13170  NADH dehydrogenase subunit E  57.33 
 
 
252 aa  245  8e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0978  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  59.53 
 
 
249 aa  243  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  55.84 
 
 
248 aa  243  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.941311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3225  NADH dehydrogenase subunit E  56.31 
 
 
283 aa  238  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0065484 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07420  NADH dehydrogenase subunit E  50.18 
 
 
319 aa  238  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0368218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1881  NADH dehydrogenase subunit E  53.16 
 
 
253 aa  236  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.54783 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0473  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  56.68 
 
 
302 aa  235  9e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2691  NADH dehydrogenase subunit E  55.24 
 
 
239 aa  233  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0285  NADH-quinone oxidoreductase subunit E  53.88 
 
 
231 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4485  NADH dehydrogenase subunit E  56.28 
 
 
287 aa  231  9e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256998  hitchhiker  0.00514085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0524  NADH dehydrogenase subunit E  53.14 
 
 
263 aa  232  9e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4414  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  53.91 
 
 
240 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  57.14 
 
 
294 aa  229  4e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0588  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit- like protein  52.25 
 
 
219 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3172  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  61.03 
 
 
237 aa  224  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0543  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  48.78 
 
 
269 aa  221  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1546  NADH dehydrogenase subunit E  48.39 
 
 
294 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67963  normal  0.132733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1576  NADH dehydrogenase subunit E  56.34 
 
 
294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.685824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1600  NADH dehydrogenase subunit E  56.34 
 
 
294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.737975  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7687  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  59.54 
 
 
228 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.85 
 
 
706 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0367  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.59 
 
 
208 aa  130  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4349  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.7 
 
 
188 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.13 
 
 
165 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1887  NADH dehydrogenase subunit E  41.14 
 
 
167 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  0.768651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2210  NADH dehydrogenase subunit E  41.14 
 
 
167 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.445986 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1016  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.62 
 
 
168 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.664946  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  39.35 
 
 
208 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2058  NADH dehydrogenase subunit E  40.82 
 
 
167 aa  113  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174503  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1312  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.62 
 
 
160 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0931  NADH dehydrogenase subunit E  41.13 
 
 
168 aa  112  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0482  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.31 
 
 
162 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.220464 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1153  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  36.2 
 
 
212 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4200  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.89 
 
 
171 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.89 
 
 
171 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4355  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.89 
 
 
171 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1267  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.26 
 
 
175 aa  109  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0876  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.72 
 
 
163 aa  109  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0961  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.72 
 
 
163 aa  109  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643352 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  38.22 
 
 
249 aa  109  7.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.49 
 
 
170 aa  109  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1295  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  40 
 
 
160 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.27 
 
 
174 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1873  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  38.93 
 
 
188 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  36.31 
 
 
270 aa  106  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1279  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.58 
 
 
183 aa  106  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0965  NADH dehydrogenase subunit E  43.9 
 
 
168 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489365  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5176  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.26 
 
 
163 aa  106  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0992  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.94 
 
 
161 aa  106  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  33.33 
 
 
166 aa  105  8e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3927  formate dehydrogenase subunit gamma  42.76 
 
 
159 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3638  formate dehydrogenase subunit gamma  42.76 
 
 
159 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2156  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.59 
 
 
224 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3252  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.42 
 
 
166 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1045  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.25 
 
 
230 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06310  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  35.42 
 
 
162 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000454733  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0913  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.16 
 
 
203 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2809  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.79 
 
 
165 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.04 
 
 
216 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103945  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.33 
 
 
170 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  35.9 
 
 
175 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.93 
 
 
166 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  36.24 
 
 
181 aa  102  1e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0806  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  33.81 
 
 
149 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.91557  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.13 
 
 
174 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0158  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  40.29 
 
 
149 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  34.21 
 
 
239 aa  100  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2703  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  36.11 
 
 
151 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1428  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.81 
 
 
165 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.464968  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  34.34 
 
 
174 aa  100  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  34.34 
 
 
174 aa  100  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.72 
 
 
166 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0990  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.48 
 
 
168 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.52 
 
 
161 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  37.41 
 
 
155 aa  99.8  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  37.41 
 
 
155 aa  99.8  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0331  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  35.14 
 
 
158 aa  99.4  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  36.88 
 
 
158 aa  99.4  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3292  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  33.33 
 
 
177 aa  99.4  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0029  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  32.35 
 
 
156 aa  99  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3822  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36 
 
 
154 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.144781  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.31 
 
 
176 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1242  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.38 
 
 
176 aa  99  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4629  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  31.69 
 
 
229 aa  97.8  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3831  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  36.05 
 
 
222 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3506  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.43 
 
 
182 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0278  bidirectional hydrogenase complex protein HoxE  40.31 
 
 
165 aa  97.8  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3083  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.13 
 
 
174 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1169  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  30.5 
 
 
160 aa  97.1  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.516989  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  32.45 
 
 
180 aa  96.3  6e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3351  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  32.34 
 
 
173 aa  96.3  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.044773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>