More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_03200 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_03200  NADH dehydrogenase subunit E  100 
 
 
253 aa  518  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6678  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  70.08 
 
 
254 aa  351  8e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0978  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  65.07 
 
 
249 aa  294  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4554  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  59.11 
 
 
341 aa  251  7e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1278  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  53.33 
 
 
230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.468909 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  57.6 
 
 
294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07420  NADH dehydrogenase subunit E  55.91 
 
 
319 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0368218 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4459  NADH dehydrogenase subunit E  52.36 
 
 
305 aa  231  6e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0271  NADH dehydrogenase subunit E  54.39 
 
 
269 aa  231  9e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0543  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  56.46 
 
 
269 aa  226  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  54.15 
 
 
273 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2691  NADH dehydrogenase subunit E  53.92 
 
 
239 aa  226  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  53.3 
 
 
248 aa  226  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.941311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0285  NADH-quinone oxidoreductase subunit E  53.07 
 
 
231 aa  224  7e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0542  NADH dehydrogenase subunit E  52.36 
 
 
262 aa  224  8e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.542965  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3225  NADH dehydrogenase subunit E  53.68 
 
 
283 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0065484 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4061  NADH dehydrogenase subunit E  53.95 
 
 
317 aa  223  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732889  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13170  NADH dehydrogenase subunit E  52.91 
 
 
252 aa  223  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0473  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  54.09 
 
 
302 aa  223  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4414  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  51.28 
 
 
240 aa  218  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0524  NADH dehydrogenase subunit E  52.09 
 
 
263 aa  217  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0588  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit- like protein  50.22 
 
 
219 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1546  NADH dehydrogenase subunit E  50.68 
 
 
294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67963  normal  0.132733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1881  NADH dehydrogenase subunit E  50.66 
 
 
253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.54783 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1576  NADH dehydrogenase subunit E  51.63 
 
 
294 aa  214  8e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.685824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1600  NADH dehydrogenase subunit E  51.63 
 
 
294 aa  214  8e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.737975  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7687  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  55.68 
 
 
228 aa  212  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4485  NADH dehydrogenase subunit E  51.36 
 
 
287 aa  211  5.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256998  hitchhiker  0.00514085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  56.57 
 
 
706 aa  204  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3172  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  57.06 
 
 
237 aa  198  6e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.99 
 
 
165 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  39.66 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.31 
 
 
166 aa  116  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0367  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.61 
 
 
208 aa  116  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1312  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.54 
 
 
160 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  36.78 
 
 
249 aa  113  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  39.2 
 
 
270 aa  112  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.15 
 
 
170 aa  111  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  33.73 
 
 
166 aa  108  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  33.16 
 
 
239 aa  108  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  35.2 
 
 
175 aa  106  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.86 
 
 
385 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1153  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  34.09 
 
 
212 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4629  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.16 
 
 
229 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  40.13 
 
 
174 aa  102  8e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  40.13 
 
 
174 aa  102  9e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06310  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  31.85 
 
 
162 aa  99.8  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000454733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.94 
 
 
161 aa  99.8  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.33 
 
 
170 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1045  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.67 
 
 
230 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  30.43 
 
 
216 aa  99.8  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103945  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2922  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.95 
 
 
264 aa  99  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.63 
 
 
174 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1960  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.82 
 
 
165 aa  97.4  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  31.64 
 
 
193 aa  97.4  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.945573 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1210  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.57 
 
 
412 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1081  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.57 
 
 
412 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.320932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.57 
 
 
412 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.84 
 
 
176 aa  96.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  31.98 
 
 
181 aa  95.9  6e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1873  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  34.73 
 
 
188 aa  95.5  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3292  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  28.49 
 
 
177 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.58 
 
 
174 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2831  NADH dehydrogenase subunit E  30.9 
 
 
228 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147014  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1016  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.97 
 
 
168 aa  94.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.664946  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0990  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.54 
 
 
168 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504399  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2056  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.57 
 
 
457 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3831  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  32.89 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  31.49 
 
 
181 aa  93.2  3e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0482  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  30.86 
 
 
162 aa  93.6  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.220464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4394  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.76 
 
 
394 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1267  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.61 
 
 
175 aa  93.2  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1924  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  30.95 
 
 
172 aa  92  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.362282  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4349  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.9 
 
 
188 aa  92  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  36.17 
 
 
155 aa  91.3  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  36.17 
 
 
155 aa  91.3  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  36.9 
 
 
168 aa  91.3  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1109  bidirectional hydrogenase complex protein HoxE  33.88 
 
 
205 aa  91.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.130681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3083  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.76 
 
 
174 aa  91.3  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.41 
 
 
163 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0913  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.71 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.41 
 
 
163 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  32.14 
 
 
180 aa  90.9  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1887  NADH dehydrogenase subunit E  37.42 
 
 
167 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  0.768651 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2296  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.77 
 
 
222 aa  90.9  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2210  NADH dehydrogenase subunit E  37.42 
 
 
167 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.445986 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.94 
 
 
166 aa  90.5  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1169  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  31.33 
 
 
160 aa  90.9  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.516989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2236  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.33 
 
 
163 aa  90.1  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  28.82 
 
 
260 aa  89.7  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1279  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  31.74 
 
 
183 aa  90.1  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0806  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  29.87 
 
 
149 aa  89.7  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.91557  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2246  NADH dehydrogenase subunit E  28.65 
 
 
239 aa  89.4  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0214593  normal  0.111261 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2156  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.52 
 
 
224 aa  89.4  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0992  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.33 
 
 
161 aa  88.6  8e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2058  NADH dehydrogenase subunit E  39.69 
 
 
167 aa  88.6  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174503  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_004310  BR0806  NADH dehydrogenase subunit E  29.73 
 
 
237 aa  88.6  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0801  NADH dehydrogenase subunit E  29.73 
 
 
237 aa  88.6  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1273  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  31.45 
 
 
160 aa  88.2  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.308673  normal  0.87612 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1627  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.33 
 
 
154 aa  87.8  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>