More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2691 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2691  NADH dehydrogenase subunit E  100 
 
 
239 aa  497  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  75.45 
 
 
248 aa  356  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.941311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4414  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  74.22 
 
 
240 aa  355  5e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0285  NADH-quinone oxidoreductase subunit E  71.36 
 
 
231 aa  332  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0588  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit- like protein  68.84 
 
 
219 aa  321  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07420  NADH dehydrogenase subunit E  66.22 
 
 
319 aa  312  2.9999999999999996e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0368218 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0473  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  67.76 
 
 
302 aa  307  8e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  67.29 
 
 
294 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0543  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  65.12 
 
 
269 aa  299  2e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0524  NADH dehydrogenase subunit E  64.93 
 
 
263 aa  291  7e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3225  NADH dehydrogenase subunit E  63.13 
 
 
283 aa  283  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0065484 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13170  NADH dehydrogenase subunit E  64.59 
 
 
252 aa  279  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7687  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  68.65 
 
 
228 aa  278  7e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1576  NADH dehydrogenase subunit E  57.85 
 
 
294 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.685824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1600  NADH dehydrogenase subunit E  57.85 
 
 
294 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.737975  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1546  NADH dehydrogenase subunit E  57.02 
 
 
294 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67963  normal  0.132733 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0271  NADH dehydrogenase subunit E  61.82 
 
 
269 aa  275  6e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4485  NADH dehydrogenase subunit E  59.91 
 
 
287 aa  270  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256998  hitchhiker  0.00514085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1881  NADH dehydrogenase subunit E  58.44 
 
 
253 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.54783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4459  NADH dehydrogenase subunit E  59.45 
 
 
305 aa  245  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4061  NADH dehydrogenase subunit E  58.18 
 
 
317 aa  244  9e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732889  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1278  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  54.5 
 
 
230 aa  238  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.468909 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0542  NADH dehydrogenase subunit E  54.87 
 
 
262 aa  237  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.542965  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3172  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  57.14 
 
 
237 aa  237  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  57 
 
 
273 aa  236  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.44 
 
 
706 aa  236  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4554  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  54.88 
 
 
341 aa  231  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03200  NADH dehydrogenase subunit E  53.54 
 
 
253 aa  230  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6678  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  53.99 
 
 
254 aa  226  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0978  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  54.33 
 
 
249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0367  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.62 
 
 
208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.85 
 
 
170 aa  131  7.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.03 
 
 
165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  42.21 
 
 
208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1312  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.45 
 
 
160 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  36.17 
 
 
239 aa  122  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  40.99 
 
 
270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  38.61 
 
 
166 aa  118  9e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1045  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.86 
 
 
230 aa  118  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2922  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.99 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3222  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.65 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.237944  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.91 
 
 
385 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2831  NADH dehydrogenase subunit E  40.12 
 
 
228 aa  115  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147014  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1873  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  36.71 
 
 
188 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1279  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.34 
 
 
183 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.48 
 
 
166 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4349  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.41 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1210  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.26 
 
 
412 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1081  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.26 
 
 
412 aa  113  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.320932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.61 
 
 
412 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2236  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.41 
 
 
163 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.62 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4629  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.61 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0913  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.22 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2809  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.78 
 
 
165 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0482  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.97 
 
 
162 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.220464 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06310  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  36.36 
 
 
162 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000454733  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0746  NADH dehydrogenase subunit E  31.53 
 
 
398 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.331264  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0893  NADH dehydrogenase subunit E  36.63 
 
 
273 aa  109  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58748  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.51 
 
 
161 aa  108  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4394  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.96 
 
 
394 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.78 
 
 
170 aa  108  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1306  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.69 
 
 
222 aa  108  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  0.728232 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  35.09 
 
 
193 aa  108  9.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.945573 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  40.28 
 
 
174 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.46 
 
 
174 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  38.75 
 
 
181 aa  107  2e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1176  NADH dehydrogenase subunit E  33.33 
 
 
395 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  40.28 
 
 
174 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  37.57 
 
 
249 aa  106  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2296  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.5 
 
 
222 aa  106  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2986  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.95 
 
 
229 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0736686  normal  0.383268 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1717  NADH dehydrogenase subunit E  35.47 
 
 
266 aa  106  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2246  NADH dehydrogenase subunit E  33.12 
 
 
239 aa  106  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0214593  normal  0.111261 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0801  NADH dehydrogenase subunit E  33.17 
 
 
237 aa  105  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0806  NADH dehydrogenase subunit E  33.17 
 
 
237 aa  105  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  36.77 
 
 
155 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1153  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  34.76 
 
 
212 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  36.43 
 
 
158 aa  105  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  36.49 
 
 
155 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0916  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  30.82 
 
 
162 aa  104  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1026  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.39 
 
 
345 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1636  NADP-reducing hydrogenase chain A  34.36 
 
 
172 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000374752  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2516  NADH dehydrogenase subunit E  30.85 
 
 
303 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1178  NADH dehydrogenase subunit E  30.85 
 
 
303 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.71 
 
 
176 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  36.25 
 
 
180 aa  102  5e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1267  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.42 
 
 
175 aa  102  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2395  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.25 
 
 
222 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0717093  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0338  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.16 
 
 
165 aa  102  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113802  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3860  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  36.88 
 
 
159 aa  102  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2056  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.66 
 
 
457 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1960  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.36 
 
 
165 aa  101  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2098  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  32.64 
 
 
186 aa  102  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.380739  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.03 
 
 
163 aa  101  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.03 
 
 
163 aa  101  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1602  NADP-reducing hydrogenase chain A  33.13 
 
 
173 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1016  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.42 
 
 
168 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.664946  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2003  NADH dehydrogenase subunit E  31.61 
 
 
303 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277346  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  34.72 
 
 
175 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>