More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3860 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3860  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  100 
 
 
159 aa  325  1.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0482  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.72 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.220464 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.36 
 
 
163 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.36 
 
 
163 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0821  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35 
 
 
164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.452585  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  37.67 
 
 
155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  37.67 
 
 
155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  35.62 
 
 
175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1312  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.71 
 
 
160 aa  107  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1016  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.94 
 
 
168 aa  107  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.664946  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3172  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.59 
 
 
237 aa  106  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28470  NADH dehydrogenase subunit E  40.52 
 
 
164 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2809  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.41 
 
 
165 aa  104  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  37.32 
 
 
706 aa  104  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  36.71 
 
 
168 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.62 
 
 
165 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2691  NADH dehydrogenase subunit E  36.88 
 
 
239 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1407  putative NADH dehydrogenase I (chain E) oxidoreductase protein  38.41 
 
 
162 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3252  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.4 
 
 
166 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4414  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.03 
 
 
240 aa  101  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1505  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.18 
 
 
175 aa  101  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00485138 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.42 
 
 
166 aa  101  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4459  NADH dehydrogenase subunit E  38.51 
 
 
305 aa  101  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2385  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  42.64 
 
 
156 aa  100  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.708436  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4061  NADH dehydrogenase subunit E  37.89 
 
 
317 aa  100  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732889  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.97 
 
 
176 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.3 
 
 
248 aa  100  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.941311 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1428  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.97 
 
 
165 aa  100  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.464968  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1045  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.21 
 
 
230 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0285  NADH-quinone oxidoreductase subunit E  39.44 
 
 
231 aa  99  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  37.33 
 
 
181 aa  99.4  2e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1153  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  35.67 
 
 
212 aa  98.6  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.21 
 
 
169 aa  99  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4200  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.46 
 
 
171 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4355  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.46 
 
 
171 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.46 
 
 
171 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1497  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.75 
 
 
162 aa  97.8  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.358345  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0271  NADH dehydrogenase subunit E  35.53 
 
 
269 aa  97.8  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.03 
 
 
170 aa  97.8  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3225  NADH dehydrogenase subunit E  38.16 
 
 
283 aa  97.1  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0065484 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1397  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.94 
 
 
176 aa  97.1  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231323  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4485  NADH dehydrogenase subunit E  37.32 
 
 
287 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256998  hitchhiker  0.00514085 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3822  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.96 
 
 
154 aa  97.1  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.144781  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  37.97 
 
 
273 aa  97.1  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0524  NADH dehydrogenase subunit E  36.62 
 
 
263 aa  96.7  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1881  NADH dehydrogenase subunit E  38.03 
 
 
253 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.54783 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07420  NADH dehydrogenase subunit E  36.88 
 
 
319 aa  96.3  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0368218 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2769  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.94 
 
 
171 aa  95.5  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217796  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2547  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.94 
 
 
176 aa  95.5  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.15313  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4349  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.97 
 
 
188 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2829  NADH dehydrogenase subunit E  37.82 
 
 
166 aa  95.9  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0584484  normal  0.465649 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.33 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0913  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.2 
 
 
203 aa  95.9  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1267  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35 
 
 
175 aa  95.5  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1279  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.42 
 
 
183 aa  95.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3424  NADH dehydrogenase subunit E  37.18 
 
 
166 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208277  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7687  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.32 
 
 
228 aa  95.5  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  32.91 
 
 
158 aa  94.7  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1495  NADH dehydrogenase subunit E  37.58 
 
 
181 aa  94.7  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1960  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.25 
 
 
165 aa  94.7  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0367  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.29 
 
 
208 aa  95.1  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3506  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.53 
 
 
182 aa  94.4  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1356  NADH dehydrogenase subunit E  33.96 
 
 
157 aa  93.6  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0803  formate dehydrogenase subunit gamma  38.41 
 
 
156 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1242  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.54 
 
 
176 aa  93.6  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  34.9 
 
 
270 aa  93.2  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0473  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.99 
 
 
302 aa  93.2  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0876  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.12 
 
 
163 aa  93.6  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5176  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.12 
 
 
163 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3708  NAD-dependent formate dehydrogenase gamma subunit  34.9 
 
 
161 aa  93.2  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.482844 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0961  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.12 
 
 
163 aa  93.6  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643352 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02210  NADH dehydrogenase subunit E  36.54 
 
 
166 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1372  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.54 
 
 
166 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00570397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2434  NADH dehydrogenase subunit E  36.54 
 
 
166 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4122  NADH dehydrogenase subunit E  36.84 
 
 
165 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3368  NADH dehydrogenase I, E subunit  37.91 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2439  NADH dehydrogenase subunit E  36.54 
 
 
166 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1870  NADH dehydrogenase subunit E  36.84 
 
 
165 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.142581 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2578  NADH dehydrogenase subunit E  36.54 
 
 
166 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.520034  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2661  NADH dehydrogenase subunit E  36.54 
 
 
166 aa  92.8  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0294149  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2752  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  39.55 
 
 
173 aa  92.8  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0899324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02170  hypothetical protein  36.54 
 
 
166 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  35.37 
 
 
208 aa  92.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.04 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0931  NADH dehydrogenase subunit E  33.95 
 
 
168 aa  92.8  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2567  NADH dehydrogenase subunit E  37.25 
 
 
166 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  31.76 
 
 
239 aa  92.4  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1367  NADH dehydrogenase subunit E  36.54 
 
 
166 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.334565  normal  0.707376 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0632  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.11 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1627  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.11 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3189  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.11 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0588  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit- like protein  36.17 
 
 
219 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3694  NADH dehydrogenase subunit E  36.84 
 
 
165 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0959076  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29980  NADH dehydrogenase subunit E  36.6 
 
 
166 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  31.68 
 
 
166 aa  91.7  4e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1018  NADH dehydrogenase subunit E  39.57 
 
 
180 aa  91.7  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3200  NADH dehydrogenase subunit E  37.5 
 
 
165 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333269  normal  0.0237431 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0933  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  33.33 
 
 
162 aa  91.7  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0911  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  33.33 
 
 
162 aa  91.7  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1743  NADH dehydrogenase subunit E  36.84 
 
 
165 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.048618  normal  0.210443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>