More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2561 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  100 
 
 
175 aa  367  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  59.38 
 
 
166 aa  211  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1960  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  62.26 
 
 
165 aa  210  7e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0821  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  56.6 
 
 
164 aa  209  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.452585  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  61.22 
 
 
155 aa  191  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  62.07 
 
 
155 aa  191  5e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  57.32 
 
 
168 aa  191  7e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0990  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  53.29 
 
 
168 aa  190  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504399  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  56.05 
 
 
176 aa  186  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  53.42 
 
 
174 aa  185  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  53.42 
 
 
174 aa  185  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  56.69 
 
 
159 aa  185  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2827  NADH dehydrogenase subunit E  48.8 
 
 
175 aa  183  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.169197  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01291  NADH dehydrogenase subunit E  48.8 
 
 
175 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17741  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  54.14 
 
 
158 aa  180  8.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1761  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  51.83 
 
 
170 aa  175  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1746  NADH dehydrogenase subunit E  53.5 
 
 
159 aa  173  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0273  NADH dehydrogenase subunit E  44.91 
 
 
175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0244  NADH dehydrogenase subunit E  45.45 
 
 
175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1887  NADH dehydrogenase subunit E  49.37 
 
 
167 aa  168  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  0.768651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2210  NADH dehydrogenase subunit E  49.37 
 
 
167 aa  167  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.445986 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  49.35 
 
 
161 aa  167  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2058  NADH dehydrogenase subunit E  48.73 
 
 
167 aa  166  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174503  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2005  NADH dehydrogenase subunit E  51.25 
 
 
161 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583559  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2269  NADH dehydrogenase subunit E  49.38 
 
 
161 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.128082  normal  0.14114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1633  NADH dehydrogenase subunit E  49.38 
 
 
161 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2245  NADH dehydrogenase subunit E  49.38 
 
 
161 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254081  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1825  NADH dehydrogenase subunit E  50.62 
 
 
161 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1439  NADH dehydrogenase subunit E  50.62 
 
 
161 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0487171  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0733  NADH dehydrogenase subunit E  50.62 
 
 
161 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1065  NADH dehydrogenase subunit E  50.62 
 
 
161 aa  164  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.331293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1134  NADH dehydrogenase subunit E  50.62 
 
 
161 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0930546  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0417  NADH dehydrogenase subunit E  50.62 
 
 
161 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1294  NADH dehydrogenase subunit E  50.62 
 
 
161 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1303  NADH dehydrogenase subunit E  50.62 
 
 
161 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5573  NADH dehydrogenase subunit E  48.75 
 
 
161 aa  163  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0826314  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2162  NADH dehydrogenase subunit E  48.75 
 
 
161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2283  NADH dehydrogenase subunit E  48.75 
 
 
161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0960667  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1032  NADH dehydrogenase subunit E  49.38 
 
 
161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0249192  normal  0.0947418 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0931  NADH dehydrogenase subunit E  49.06 
 
 
168 aa  161  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3210  NADH dehydrogenase subunit E  49.38 
 
 
161 aa  160  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1347  NADH dehydrogenase subunit E  49.38 
 
 
161 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00701728  normal  0.0175389 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.77 
 
 
163 aa  155  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.77 
 
 
163 aa  155  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.45 
 
 
170 aa  155  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0953  NADH dehydrogenase subunit E  46.84 
 
 
157 aa  154  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.544073 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0965  NADH dehydrogenase subunit E  46.2 
 
 
168 aa  153  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489365  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1378  NADH dehydrogenase I chain E  47.89 
 
 
177 aa  151  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.41658  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  48.95 
 
 
165 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1242  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.75 
 
 
176 aa  149  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1428  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.14 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.464968  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3252  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.77 
 
 
166 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1267  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.9 
 
 
175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  44.87 
 
 
239 aa  144  6e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  47.26 
 
 
181 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1047  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.5 
 
 
168 aa  142  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  42.86 
 
 
166 aa  141  4e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  43.86 
 
 
270 aa  140  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  47.14 
 
 
180 aa  139  9.999999999999999e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0825  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.5 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1497  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.14 
 
 
162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.358345  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0876  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.14 
 
 
163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0961  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.14 
 
 
163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643352 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3506  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.68 
 
 
182 aa  138  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.77 
 
 
171 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4355  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.77 
 
 
171 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4200  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.77 
 
 
171 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.36 
 
 
216 aa  136  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103945  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2809  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.83 
 
 
165 aa  135  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5176  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.87 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  44.14 
 
 
249 aa  135  4e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.7 
 
 
385 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1081  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.85 
 
 
412 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.320932 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1210  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.85 
 
 
412 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  41.03 
 
 
181 aa  132  3e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4349  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.51 
 
 
188 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  39.63 
 
 
260 aa  130  9e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.45 
 
 
412 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4394  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.15 
 
 
394 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.24 
 
 
170 aa  128  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2831  NADH dehydrogenase subunit E  39.16 
 
 
228 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147014  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.45 
 
 
166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1505  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.76 
 
 
175 aa  127  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00485138 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.11 
 
 
169 aa  127  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2986  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.43 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0736686  normal  0.383268 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  43.75 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1312  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.22 
 
 
160 aa  125  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1359  NADH dehydrogenase subunit E  39.18 
 
 
221 aa  125  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.127402  normal  0.0368394 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0482  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.03 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.220464 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42 
 
 
174 aa  124  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2296  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.43 
 
 
222 aa  124  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42 
 
 
174 aa  124  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1306  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.29 
 
 
222 aa  124  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  0.728232 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2922  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.72 
 
 
264 aa  124  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1407  putative NADH dehydrogenase I (chain E) oxidoreductase protein  44.78 
 
 
162 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  39.74 
 
 
273 aa  121  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0632  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.37 
 
 
154 aa  121  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1627  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.37 
 
 
154 aa  121  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3189  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.37 
 
 
154 aa  121  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3822  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.91 
 
 
154 aa  120  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.144781  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>