More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1407 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1407  putative NADH dehydrogenase I (chain E) oxidoreductase protein  100 
 
 
162 aa  337  5e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1505  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  71.25 
 
 
175 aa  243  6.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00485138 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3252  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  69.57 
 
 
166 aa  241  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1428  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  71.05 
 
 
165 aa  234  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.464968  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0876  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  69.57 
 
 
163 aa  233  9e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0961  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  69.57 
 
 
163 aa  233  9e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643352 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1267  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  71.05 
 
 
175 aa  233  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2809  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  70.39 
 
 
165 aa  229  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5176  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  68.32 
 
 
163 aa  228  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3506  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  68.12 
 
 
182 aa  226  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1497  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  64.97 
 
 
162 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.358345  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2210  NADH dehydrogenase subunit E  55 
 
 
167 aa  185  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.445986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2058  NADH dehydrogenase subunit E  55 
 
 
167 aa  184  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174503  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1887  NADH dehydrogenase subunit E  55 
 
 
167 aa  184  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  0.768651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0965  NADH dehydrogenase subunit E  54.55 
 
 
168 aa  180  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489365  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0931  NADH dehydrogenase subunit E  52.5 
 
 
168 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1047  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  53.12 
 
 
168 aa  177  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
158 aa  175  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0825  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  51.88 
 
 
167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0953  NADH dehydrogenase subunit E  51.97 
 
 
157 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.544073 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1746  NADH dehydrogenase subunit E  50.32 
 
 
159 aa  167  8e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2005  NADH dehydrogenase subunit E  48.45 
 
 
161 aa  164  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583559  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1347  NADH dehydrogenase subunit E  49.34 
 
 
161 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00701728  normal  0.0175389 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3210  NADH dehydrogenase subunit E  49.34 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1825  NADH dehydrogenase subunit E  48.45 
 
 
161 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1439  NADH dehydrogenase subunit E  48.45 
 
 
161 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0487171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1294  NADH dehydrogenase subunit E  48.45 
 
 
161 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1134  NADH dehydrogenase subunit E  48.45 
 
 
161 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0930546  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0417  NADH dehydrogenase subunit E  48.45 
 
 
161 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1065  NADH dehydrogenase subunit E  48.45 
 
 
161 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.331293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1303  NADH dehydrogenase subunit E  48.45 
 
 
161 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0733  NADH dehydrogenase subunit E  48.45 
 
 
161 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1032  NADH dehydrogenase subunit E  46.58 
 
 
161 aa  156  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0249192  normal  0.0947418 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  50.66 
 
 
168 aa  155  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5573  NADH dehydrogenase subunit E  47.2 
 
 
161 aa  155  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0826314  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2269  NADH dehydrogenase subunit E  45.96 
 
 
161 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.128082  normal  0.14114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1633  NADH dehydrogenase subunit E  45.96 
 
 
161 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2245  NADH dehydrogenase subunit E  45.96 
 
 
161 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254081  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  47.95 
 
 
155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  48.61 
 
 
155 aa  154  6e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2162  NADH dehydrogenase subunit E  45.96 
 
 
161 aa  154  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2283  NADH dehydrogenase subunit E  45.96 
 
 
161 aa  154  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0960667  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.16 
 
 
159 aa  152  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.47 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.47 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0821  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44 
 
 
164 aa  133  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.452585  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0990  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.18 
 
 
168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504399  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  38.04 
 
 
174 aa  127  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  41.03 
 
 
175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  37.89 
 
 
174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.87 
 
 
176 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  38.96 
 
 
239 aa  120  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.85 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1960  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.76 
 
 
165 aa  117  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  36.94 
 
 
270 aa  115  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2986  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.1 
 
 
229 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0736686  normal  0.383268 
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  37.67 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2827  NADH dehydrogenase subunit E  35.9 
 
 
175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.169197  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  43.07 
 
 
273 aa  111  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  43.55 
 
 
208 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01291  NADH dehydrogenase subunit E  37.18 
 
 
175 aa  110  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17741  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.95 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1242  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.26 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.06 
 
 
170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.11 
 
 
165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1359  NADH dehydrogenase subunit E  39.51 
 
 
221 aa  108  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.127402  normal  0.0368394 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  37.18 
 
 
181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1306  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.14 
 
 
222 aa  107  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  0.728232 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.58 
 
 
169 aa  108  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0244  NADH dehydrogenase subunit E  37.18 
 
 
175 aa  107  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0273  NADH dehydrogenase subunit E  37.18 
 
 
175 aa  107  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4349  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.42 
 
 
188 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2831  NADH dehydrogenase subunit E  40 
 
 
228 aa  107  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147014  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2296  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.87 
 
 
222 aa  106  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.58 
 
 
174 aa  106  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3860  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  37.11 
 
 
159 aa  105  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.72 
 
 
170 aa  105  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4629  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.86 
 
 
229 aa  105  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0632  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.91 
 
 
154 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1627  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.91 
 
 
154 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3189  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.91 
 
 
154 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.75 
 
 
171 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4355  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.75 
 
 
171 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4200  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.75 
 
 
171 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.31 
 
 
174 aa  104  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_7050  predicted protein  36.69 
 
 
217 aa  103  8e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000378621  hitchhiker  0.000000494703 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.17 
 
 
216 aa  103  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103945  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0542  NADH dehydrogenase subunit E  43.07 
 
 
262 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.542965  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0925  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.69 
 
 
203 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1761  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.75 
 
 
170 aa  102  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0482  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.23 
 
 
162 aa  100  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.220464 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1016  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.95 
 
 
168 aa  100  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.664946  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  40.8 
 
 
181 aa  100  8e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0154  NADH dehydrogenase subunit E  38.52 
 
 
173 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.03 
 
 
166 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1045  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.62 
 
 
230 aa  99.8  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1924  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.78 
 
 
172 aa  99.4  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.362282  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  37.06 
 
 
180 aa  99  2e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4459  NADH dehydrogenase subunit E  38.52 
 
 
305 aa  99.8  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4061  NADH dehydrogenase subunit E  38.52 
 
 
317 aa  99  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732889  normal  0.108394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>