More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0925 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0925  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  100 
 
 
203 aa  420  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  60.73 
 
 
216 aa  237  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103945  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2986  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  54.5 
 
 
229 aa  203  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0736686  normal  0.383268 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1306  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  51.05 
 
 
222 aa  194  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  0.728232 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  48.44 
 
 
208 aa  179  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2296  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  49.15 
 
 
222 aa  176  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  46.94 
 
 
239 aa  176  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4558  NADH dehydrogenase subunit E  49.49 
 
 
203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147292 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2395  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.26 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0717093  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2922  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  48 
 
 
264 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3222  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  49.5 
 
 
208 aa  171  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.237944  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4629  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  49.74 
 
 
229 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1359  NADH dehydrogenase subunit E  47.87 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.127402  normal  0.0368394 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  48.47 
 
 
181 aa  162  3e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1264  NADH dehydrogenase subunit E  48.74 
 
 
388 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2003  NADH dehydrogenase subunit E  45.64 
 
 
303 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277346  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1717  NADH dehydrogenase subunit E  47.24 
 
 
266 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2406  NADH dehydrogenase subunit E  44.88 
 
 
265 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979437 
 
 
-
 
NC_004310  BR0806  NADH dehydrogenase subunit E  47 
 
 
237 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0801  NADH dehydrogenase subunit E  47 
 
 
237 aa  159  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1356  NADH dehydrogenase subunit E  48.24 
 
 
388 aa  158  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0893  NADH dehydrogenase subunit E  47 
 
 
273 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58748  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1883  NADH dehydrogenase subunit E  45.55 
 
 
250 aa  156  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2216  NADH dehydrogenase subunit E  45.55 
 
 
228 aa  156  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  47.93 
 
 
166 aa  155  4e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  44.72 
 
 
270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2882  NADH dehydrogenase subunit E  46.6 
 
 
249 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2419  NADH dehydrogenase subunit E  46 
 
 
385 aa  154  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  44.9 
 
 
260 aa  154  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2056  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  48.15 
 
 
457 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1313  NADH dehydrogenase subunit E  43.68 
 
 
402 aa  153  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0324148  normal  0.032376 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2577  NADH dehydrogenase subunit E  46.6 
 
 
249 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.251247  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0782  NADH dehydrogenase subunit E  45.05 
 
 
225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.916923  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3295  NADH dehydrogenase subunit E  45.13 
 
 
249 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.74 
 
 
385 aa  151  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2516  NADH dehydrogenase subunit E  42.56 
 
 
303 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1178  NADH dehydrogenase subunit E  42.56 
 
 
303 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.28 
 
 
412 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4394  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.28 
 
 
394 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1210  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.28 
 
 
412 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1026  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.03 
 
 
345 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1081  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.28 
 
 
412 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.320932 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  48.39 
 
 
170 aa  149  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  41.62 
 
 
181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2246  NADH dehydrogenase subunit E  41.84 
 
 
239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0214593  normal  0.111261 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2831  NADH dehydrogenase subunit E  44.74 
 
 
228 aa  143  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147014  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  43.56 
 
 
180 aa  144  1e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  41.04 
 
 
249 aa  142  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0746  NADH dehydrogenase subunit E  39.6 
 
 
398 aa  140  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.331264  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_7050  predicted protein  41 
 
 
217 aa  136  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000378621  hitchhiker  0.000000494703 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1176  NADH dehydrogenase subunit E  40.31 
 
 
395 aa  135  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.89 
 
 
161 aa  126  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1378  NADH dehydrogenase I chain E  36.93 
 
 
177 aa  126  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.41658  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.52 
 
 
165 aa  122  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  36.26 
 
 
174 aa  117  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  36.26 
 
 
174 aa  117  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.4 
 
 
169 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  38.96 
 
 
155 aa  111  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  38.96 
 
 
155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.89 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.89 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0482  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.35 
 
 
162 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.220464 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1960  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.91 
 
 
165 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0876  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.56 
 
 
163 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0961  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.56 
 
 
163 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643352 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.66 
 
 
170 aa  106  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  38.26 
 
 
175 aa  106  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  38 
 
 
158 aa  106  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.27 
 
 
166 aa  106  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1242  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.2 
 
 
176 aa  106  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1505  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.07 
 
 
175 aa  105  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00485138 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0821  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.16 
 
 
164 aa  105  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.452585  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2058  NADH dehydrogenase subunit E  39.26 
 
 
167 aa  105  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174503  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2210  NADH dehydrogenase subunit E  39.26 
 
 
167 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.445986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2809  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.12 
 
 
165 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.26 
 
 
174 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  37.18 
 
 
168 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.94 
 
 
166 aa  103  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1045  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.04 
 
 
230 aa  103  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1887  NADH dehydrogenase subunit E  38.65 
 
 
167 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  0.768651 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1407  putative NADH dehydrogenase I (chain E) oxidoreductase protein  40.69 
 
 
162 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1267  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.25 
 
 
175 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0992  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.69 
 
 
161 aa  101  7e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  34.39 
 
 
273 aa  101  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0931  NADH dehydrogenase subunit E  39.26 
 
 
168 aa  101  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2827  NADH dehydrogenase subunit E  31.74 
 
 
175 aa  101  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.169197  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1428  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.94 
 
 
165 aa  101  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.464968  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0965  NADH dehydrogenase subunit E  42.25 
 
 
168 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489365  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01291  NADH dehydrogenase subunit E  31.74 
 
 
175 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17741  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2005  NADH dehydrogenase subunit E  39.1 
 
 
161 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583559  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.97 
 
 
174 aa  99.4  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0990  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.95 
 
 
168 aa  99  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504399  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0721  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.18 
 
 
157 aa  98.2  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000389921  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0697  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.18 
 
 
157 aa  98.2  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000280605  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1347  NADH dehydrogenase subunit E  39.1 
 
 
161 aa  97.8  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00701728  normal  0.0175389 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0471  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  31.18 
 
 
195 aa  97.8  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.671708  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3210  NADH dehydrogenase subunit E  39.1 
 
 
161 aa  97.8  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1047  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.5 
 
 
168 aa  97.8  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1153  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  38.46 
 
 
212 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1279  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.18 
 
 
183 aa  96.3  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>