More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1264 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1264  NADH dehydrogenase subunit E  100 
 
 
388 aa  790    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1356  NADH dehydrogenase subunit E  96.13 
 
 
388 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2419  NADH dehydrogenase subunit E  61.33 
 
 
385 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1717  NADH dehydrogenase subunit E  69.7 
 
 
266 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0893  NADH dehydrogenase subunit E  71.37 
 
 
273 aa  348  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58748  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1026  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  67.06 
 
 
345 aa  340  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0801  NADH dehydrogenase subunit E  73.4 
 
 
237 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0806  NADH dehydrogenase subunit E  73.4 
 
 
237 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0782  NADH dehydrogenase subunit E  71.57 
 
 
225 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.916923  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0746  NADH dehydrogenase subunit E  44.72 
 
 
398 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.331264  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1313  NADH dehydrogenase subunit E  44.53 
 
 
402 aa  302  5.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0324148  normal  0.032376 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1176  NADH dehydrogenase subunit E  45.23 
 
 
395 aa  300  4e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1883  NADH dehydrogenase subunit E  63.55 
 
 
250 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2216  NADH dehydrogenase subunit E  64.04 
 
 
228 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4558  NADH dehydrogenase subunit E  64.18 
 
 
203 aa  263  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2406  NADH dehydrogenase subunit E  60.1 
 
 
265 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979437 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2577  NADH dehydrogenase subunit E  62.07 
 
 
249 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.251247  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2882  NADH dehydrogenase subunit E  61.08 
 
 
249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3295  NADH dehydrogenase subunit E  61.08 
 
 
249 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2056  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.17 
 
 
457 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.08 
 
 
412 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1210  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.87 
 
 
412 aa  248  9e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1081  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.87 
 
 
412 aa  248  9e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.320932 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1178  NADH dehydrogenase subunit E  46.76 
 
 
303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2003  NADH dehydrogenase subunit E  46.76 
 
 
303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277346  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2516  NADH dehydrogenase subunit E  56.59 
 
 
303 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2246  NADH dehydrogenase subunit E  56.57 
 
 
239 aa  222  7e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0214593  normal  0.111261 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2831  NADH dehydrogenase subunit E  55.87 
 
 
228 aa  213  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147014  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3222  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  55.67 
 
 
208 aa  212  9e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.237944  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2922  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  54.19 
 
 
264 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4394  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.13 
 
 
394 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  54.41 
 
 
385 aa  209  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4629  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  54.46 
 
 
229 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2395  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  52.22 
 
 
222 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0717093  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2986  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  51.74 
 
 
229 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0736686  normal  0.383268 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1359  NADH dehydrogenase subunit E  49.77 
 
 
221 aa  187  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.127402  normal  0.0368394 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  45.55 
 
 
208 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1306  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  49.01 
 
 
222 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  0.728232 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2296  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.43 
 
 
222 aa  162  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0925  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  48.74 
 
 
203 aa  162  9e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  49.35 
 
 
166 aa  159  1e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.93 
 
 
216 aa  156  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103945  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  39.07 
 
 
239 aa  152  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  41.36 
 
 
249 aa  142  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.3 
 
 
170 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  46.45 
 
 
180 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  40.72 
 
 
181 aa  137  5e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  43.59 
 
 
181 aa  135  9.999999999999999e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  39.2 
 
 
260 aa  134  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  37.82 
 
 
270 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.86 
 
 
161 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_7050  predicted protein  33.98 
 
 
217 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000378621  hitchhiker  0.000000494703 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.89 
 
 
165 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.04 
 
 
170 aa  116  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1378  NADH dehydrogenase I chain E  37.11 
 
 
177 aa  116  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.41658  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  38.51 
 
 
174 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.86 
 
 
163 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.86 
 
 
163 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  38.36 
 
 
174 aa  113  5e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0821  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40 
 
 
164 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.452585  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.22 
 
 
166 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  38.36 
 
 
155 aa  109  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  38.36 
 
 
155 aa  109  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.16 
 
 
169 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0271  NADH dehydrogenase subunit E  31.86 
 
 
269 aa  106  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.42 
 
 
176 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.93 
 
 
166 aa  103  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0990  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.19 
 
 
168 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504399  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  36.36 
 
 
168 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  35.9 
 
 
175 aa  102  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4459  NADH dehydrogenase subunit E  31.4 
 
 
305 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0542  NADH dehydrogenase subunit E  35 
 
 
262 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.542965  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07420  NADH dehydrogenase subunit E  29.58 
 
 
319 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0368218 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1242  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.81 
 
 
176 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1505  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.91 
 
 
175 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00485138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1881  NADH dehydrogenase subunit E  34.93 
 
 
253 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.54783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0338  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.99 
 
 
165 aa  99.4  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113802  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2058  NADH dehydrogenase subunit E  41.22 
 
 
167 aa  99  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174503  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  37.5 
 
 
158 aa  99  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2210  NADH dehydrogenase subunit E  41.22 
 
 
167 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.445986 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4061  NADH dehydrogenase subunit E  30.81 
 
 
317 aa  99  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732889  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1312  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.26 
 
 
160 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0543  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  29.17 
 
 
269 aa  99.4  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1960  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.67 
 
 
165 aa  98.2  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  32.28 
 
 
273 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.33 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.69 
 
 
159 aa  97.4  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2691  NADH dehydrogenase subunit E  30.84 
 
 
239 aa  97.4  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1887  NADH dehydrogenase subunit E  40.46 
 
 
167 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  0.768651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4485  NADH dehydrogenase subunit E  33.72 
 
 
287 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256998  hitchhiker  0.00514085 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2236  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.47 
 
 
163 aa  96.7  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0524  NADH dehydrogenase subunit E  33.52 
 
 
263 aa  96.7  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2827  NADH dehydrogenase subunit E  35.26 
 
 
175 aa  96.3  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.169197  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1347  NADH dehydrogenase subunit E  38.76 
 
 
161 aa  96.3  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00701728  normal  0.0175389 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4349  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.62 
 
 
188 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1439  NADH dehydrogenase subunit E  40.31 
 
 
161 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0487171  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0733  NADH dehydrogenase subunit E  40.31 
 
 
161 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1294  NADH dehydrogenase subunit E  40.31 
 
 
161 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1065  NADH dehydrogenase subunit E  40.31 
 
 
161 aa  95.9  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.331293  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0417  NADH dehydrogenase subunit E  40.31 
 
 
161 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>