More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3332 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  100 
 
 
216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103945  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0925  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  60.73 
 
 
203 aa  237  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2986  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.03 
 
 
229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0736686  normal  0.383268 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1359  NADH dehydrogenase subunit E  49 
 
 
221 aa  181  7e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.127402  normal  0.0368394 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  46.91 
 
 
208 aa  180  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1306  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.36 
 
 
222 aa  176  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  0.728232 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  42.25 
 
 
239 aa  175  4e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3222  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.62 
 
 
208 aa  174  8e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.237944  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2395  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.91 
 
 
222 aa  172  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0717093  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  46.33 
 
 
181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4629  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.39 
 
 
229 aa  169  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1176  NADH dehydrogenase subunit E  44 
 
 
395 aa  168  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2296  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.36 
 
 
222 aa  168  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.91 
 
 
170 aa  167  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  44.09 
 
 
260 aa  167  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1313  NADH dehydrogenase subunit E  43.5 
 
 
402 aa  164  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0324148  normal  0.032376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2831  NADH dehydrogenase subunit E  44.67 
 
 
228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147014  normal  0.209682 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  41.79 
 
 
270 aa  162  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1026  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.06 
 
 
345 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  40.51 
 
 
249 aa  161  7e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2922  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.3 
 
 
264 aa  160  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  45.18 
 
 
166 aa  158  5e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2003  NADH dehydrogenase subunit E  41.84 
 
 
303 aa  158  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277346  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0806  NADH dehydrogenase subunit E  42.11 
 
 
237 aa  157  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0801  NADH dehydrogenase subunit E  42.11 
 
 
237 aa  157  8e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1264  NADH dehydrogenase subunit E  42.93 
 
 
388 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1356  NADH dehydrogenase subunit E  42.93 
 
 
388 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2419  NADH dehydrogenase subunit E  41.63 
 
 
385 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1883  NADH dehydrogenase subunit E  42.35 
 
 
250 aa  157  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  42.26 
 
 
181 aa  156  2e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2216  NADH dehydrogenase subunit E  40.78 
 
 
228 aa  155  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1178  NADH dehydrogenase subunit E  41.33 
 
 
303 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2516  NADH dehydrogenase subunit E  41.33 
 
 
303 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0746  NADH dehydrogenase subunit E  42.79 
 
 
398 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.331264  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2406  NADH dehydrogenase subunit E  40.1 
 
 
265 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979437 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0893  NADH dehydrogenase subunit E  41.2 
 
 
273 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58748  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0782  NADH dehydrogenase subunit E  39.91 
 
 
225 aa  152  4e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.916923  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3295  NADH dehydrogenase subunit E  41.06 
 
 
249 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.86 
 
 
385 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  42.26 
 
 
180 aa  151  7e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2577  NADH dehydrogenase subunit E  42.27 
 
 
249 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.251247  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2056  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.21 
 
 
457 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4558  NADH dehydrogenase subunit E  42.13 
 
 
203 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.84 
 
 
412 aa  148  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1717  NADH dehydrogenase subunit E  40.38 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1210  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.33 
 
 
412 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1081  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.33 
 
 
412 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.320932 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2882  NADH dehydrogenase subunit E  41.24 
 
 
249 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_7050  predicted protein  37.85 
 
 
217 aa  142  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000378621  hitchhiker  0.000000494703 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  40.23 
 
 
174 aa  142  4e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  40.23 
 
 
174 aa  142  5e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2246  NADH dehydrogenase subunit E  39.9 
 
 
239 aa  141  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0214593  normal  0.111261 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4394  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.31 
 
 
394 aa  141  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  41.36 
 
 
175 aa  136  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.36 
 
 
161 aa  136  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40 
 
 
165 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.62 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4349  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.36 
 
 
188 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1960  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.39 
 
 
165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1378  NADH dehydrogenase I chain E  36.36 
 
 
177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.41658  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.77 
 
 
163 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.77 
 
 
163 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.62 
 
 
169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  39.49 
 
 
155 aa  124  9e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  41.38 
 
 
155 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0482  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.88 
 
 
162 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.220464 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.14 
 
 
174 aa  122  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2827  NADH dehydrogenase subunit E  37.74 
 
 
175 aa  121  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.169197  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1312  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.76 
 
 
160 aa  121  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.85 
 
 
174 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1242  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.18 
 
 
176 aa  119  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.65 
 
 
166 aa  118  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.94 
 
 
171 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4355  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.94 
 
 
171 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4200  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.94 
 
 
171 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  41.96 
 
 
158 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01291  NADH dehydrogenase subunit E  36.48 
 
 
175 aa  116  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17741  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  36.71 
 
 
273 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.06 
 
 
170 aa  114  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2210  NADH dehydrogenase subunit E  41.96 
 
 
167 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.445986 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1267  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.88 
 
 
175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1887  NADH dehydrogenase subunit E  41.96 
 
 
167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  0.768651 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  36.81 
 
 
168 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.54 
 
 
159 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2058  NADH dehydrogenase subunit E  41.26 
 
 
167 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174503  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0876  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.75 
 
 
163 aa  112  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0961  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.75 
 
 
163 aa  112  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643352 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0273  NADH dehydrogenase subunit E  34.81 
 
 
175 aa  111  9e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0990  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.93 
 
 
168 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504399  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0821  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.33 
 
 
164 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.452585  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0244  NADH dehydrogenase subunit E  34.81 
 
 
175 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2809  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.08 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0931  NADH dehydrogenase subunit E  36.63 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0965  NADH dehydrogenase subunit E  39.86 
 
 
168 aa  108  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489365  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0542  NADH dehydrogenase subunit E  36.84 
 
 
262 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.542965  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0992  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.13 
 
 
161 aa  107  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1045  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.58 
 
 
230 aa  106  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.2 
 
 
176 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3252  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.46 
 
 
166 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1497  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.52 
 
 
162 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.358345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>