More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4130 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  100 
 
 
385 aa  778    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4394  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  78.46 
 
 
394 aa  595  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1081  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  67.24 
 
 
412 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.320932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  75.17 
 
 
412 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1210  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  67.24 
 
 
412 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2056  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  72.58 
 
 
457 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2395  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  69.19 
 
 
222 aa  291  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0717093  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2922  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  65.66 
 
 
264 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4629  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  65.02 
 
 
229 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3222  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  61.81 
 
 
208 aa  261  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.237944  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1883  NADH dehydrogenase subunit E  58.37 
 
 
250 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2003  NADH dehydrogenase subunit E  64.21 
 
 
303 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277346  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0746  NADH dehydrogenase subunit E  60.1 
 
 
398 aa  242  7.999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.331264  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1313  NADH dehydrogenase subunit E  61.11 
 
 
402 aa  241  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0324148  normal  0.032376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4558  NADH dehydrogenase subunit E  60.59 
 
 
203 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147292 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2831  NADH dehydrogenase subunit E  58.57 
 
 
228 aa  239  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147014  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2577  NADH dehydrogenase subunit E  59.8 
 
 
249 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.251247  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1178  NADH dehydrogenase subunit E  61.58 
 
 
303 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3295  NADH dehydrogenase subunit E  59.8 
 
 
249 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2516  NADH dehydrogenase subunit E  61.58 
 
 
303 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2882  NADH dehydrogenase subunit E  59.3 
 
 
249 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2246  NADH dehydrogenase subunit E  61.11 
 
 
239 aa  235  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0214593  normal  0.111261 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1176  NADH dehydrogenase subunit E  59.3 
 
 
395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2216  NADH dehydrogenase subunit E  57.5 
 
 
228 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2406  NADH dehydrogenase subunit E  58.29 
 
 
265 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1026  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  56.52 
 
 
345 aa  223  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1359  NADH dehydrogenase subunit E  53.55 
 
 
221 aa  218  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.127402  normal  0.0368394 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1717  NADH dehydrogenase subunit E  56.59 
 
 
266 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2419  NADH dehydrogenase subunit E  46.02 
 
 
385 aa  215  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0893  NADH dehydrogenase subunit E  55.72 
 
 
273 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58748  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0806  NADH dehydrogenase subunit E  54.46 
 
 
237 aa  212  7.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0801  NADH dehydrogenase subunit E  54.46 
 
 
237 aa  212  7.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1356  NADH dehydrogenase subunit E  54.41 
 
 
388 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0782  NADH dehydrogenase subunit E  54.41 
 
 
225 aa  210  3e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.916923  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1264  NADH dehydrogenase subunit E  54.41 
 
 
388 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2296  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.77 
 
 
222 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1306  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  55.26 
 
 
222 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  0.728232 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2986  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  51.49 
 
 
229 aa  193  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0736686  normal  0.383268 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  53.19 
 
 
208 aa  188  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  48.92 
 
 
249 aa  182  1e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  51.23 
 
 
260 aa  180  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  49.39 
 
 
166 aa  178  1e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  45.64 
 
 
270 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  45.56 
 
 
181 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  48.7 
 
 
180 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  44.75 
 
 
239 aa  160  4e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.86 
 
 
170 aa  153  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  44.77 
 
 
181 aa  152  1e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.86 
 
 
216 aa  151  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103945  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0925  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.74 
 
 
203 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.79 
 
 
165 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_7050  predicted protein  41.44 
 
 
217 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000378621  hitchhiker  0.000000494703 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.51 
 
 
161 aa  136  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.83 
 
 
176 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  45.7 
 
 
175 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  41.72 
 
 
174 aa  133  5e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.33 
 
 
163 aa  133  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.95 
 
 
166 aa  133  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.33 
 
 
163 aa  133  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  41.72 
 
 
174 aa  133  6e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1378  NADH dehydrogenase I chain E  40.85 
 
 
177 aa  131  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.41658  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2156  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.23 
 
 
224 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0990  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.16 
 
 
168 aa  129  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504399  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.64 
 
 
166 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1761  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.59 
 
 
170 aa  124  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  44.68 
 
 
155 aa  123  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0542  NADH dehydrogenase subunit E  38.27 
 
 
262 aa  123  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.542965  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  44.68 
 
 
155 aa  123  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0821  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.36 
 
 
164 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.452585  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1242  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.96 
 
 
176 aa  119  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.18 
 
 
170 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.14 
 
 
174 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0953  NADH dehydrogenase subunit E  40.65 
 
 
157 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.544073 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2691  NADH dehydrogenase subunit E  40.91 
 
 
239 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0273  NADH dehydrogenase subunit E  44.44 
 
 
175 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.97 
 
 
174 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3083  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.12 
 
 
174 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0244  NADH dehydrogenase subunit E  44.44 
 
 
175 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  44.14 
 
 
168 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1960  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.58 
 
 
165 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1045  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.83 
 
 
230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0285  NADH-quinone oxidoreductase subunit E  41.45 
 
 
231 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  37.58 
 
 
273 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1278  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  35.54 
 
 
230 aa  113  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.468909 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0271  NADH dehydrogenase subunit E  39.61 
 
 
269 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0417  NADH dehydrogenase subunit E  42.57 
 
 
161 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1825  NADH dehydrogenase subunit E  42.57 
 
 
161 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1439  NADH dehydrogenase subunit E  42.57 
 
 
161 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0487171  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0733  NADH dehydrogenase subunit E  42.57 
 
 
161 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  36.94 
 
 
158 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1065  NADH dehydrogenase subunit E  42.57 
 
 
161 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.331293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1294  NADH dehydrogenase subunit E  42.57 
 
 
161 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1134  NADH dehydrogenase subunit E  42.57 
 
 
161 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0930546  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1303  NADH dehydrogenase subunit E  42.57 
 
 
161 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4459  NADH dehydrogenase subunit E  35.62 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.86 
 
 
169 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.74 
 
 
159 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4061  NADH dehydrogenase subunit E  34.68 
 
 
317 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732889  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1032  NADH dehydrogenase subunit E  40.54 
 
 
161 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0249192  normal  0.0947418 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1746  NADH dehydrogenase subunit E  39.74 
 
 
159 aa  109  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>