More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4558 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4558  NADH dehydrogenase subunit E  100 
 
 		 203 aa  425  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147292 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1883  NADH dehydrogenase subunit E  82.41 
 
 		 250 aa  357  5e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2216  NADH dehydrogenase subunit E  82.41 
 
 		 228 aa  356  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2882  NADH dehydrogenase subunit E  83 
 
 		 249 aa  355  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2406  NADH dehydrogenase subunit E  81.5 
 
 		 265 aa  354  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979437 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2577  NADH dehydrogenase subunit E  83 
 
 		 249 aa  353  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.251247  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3295  NADH dehydrogenase subunit E  83 
 
 		 249 aa  352  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0806  NADH dehydrogenase subunit E  65.52 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0801  NADH dehydrogenase subunit E  65.52 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0893  NADH dehydrogenase subunit E  66.34 
 
 		 273 aa  273  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2419  NADH dehydrogenase subunit E  64.04 
 
 		 385 aa  268  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1717  NADH dehydrogenase subunit E  63.73 
 
 		 266 aa  264  8e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1264  NADH dehydrogenase subunit E  64.18 
 
 		 388 aa  262  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1313  NADH dehydrogenase subunit E  65.33 
 
 		 402 aa  262  3e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0324148  normal  0.032376 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2246  NADH dehydrogenase subunit E  65 
 
 		 239 aa  260  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0214593  normal  0.111261 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1356  NADH dehydrogenase subunit E  63.68 
 
 		 388 aa  258  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1026  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  63.41 
 
 		 345 aa  257  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0746  NADH dehydrogenase subunit E  63.82 
 
 		 398 aa  256  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.331264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1178  NADH dehydrogenase subunit E  63.32 
 
 		 303 aa  254  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2516  NADH dehydrogenase subunit E  63.32 
 
 		 303 aa  253  9e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1176  NADH dehydrogenase subunit E  62.31 
 
 		 395 aa  253  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2003  NADH dehydrogenase subunit E  62.81 
 
 		 303 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0782  NADH dehydrogenase subunit E  60.7 
 
 		 225 aa  248  3e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.916923  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3222  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  64.82 
 
 		 208 aa  248  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.237944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4394  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  61.17 
 
 		 394 aa  244  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  60.59 
 
 		 385 aa  239  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2056  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  60.59 
 
 		 457 aa  235  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2922  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  59.8 
 
 		 264 aa  232  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4629  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  60.2 
 
 		 229 aa  231  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  58.13 
 
 		 412 aa  228  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1081  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  57.64 
 
 		 412 aa  225  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.320932 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1210  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  57.64 
 
 		 412 aa  225  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2831  NADH dehydrogenase subunit E  60.2 
 
 		 228 aa  221  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147014  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2395  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  56.28 
 
 		 222 aa  214  5e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0717093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1359  NADH dehydrogenase subunit E  56.06 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.127402  normal  0.0368394 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  51.85 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2986  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  52.06 
 
 		 229 aa  186  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0736686  normal  0.383268 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1306  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  51.55 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  0.728232 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  48.68 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0925  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  49.49 
 
 		 203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  52.26 
 
 		 166 aa  162  3e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2296  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.6 
 
 		 222 aa  160  8.000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  43.72 
 
 		 239 aa  159  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  46.71 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  40.67 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  47.74 
 
 		 180 aa  150  2e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.13 
 
 		 216 aa  149  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103945  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.28 
 
 		 170 aa  145  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  44.23 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  41.21 
 
 		 260 aa  142  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.45 
 
 		 161 aa  135  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_7050  predicted protein  39.61 
 
 		 217 aa  134  8e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000378621  hitchhiker  0.000000494703 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1378  NADH dehydrogenase I chain E  40.88 
 
 		 177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.41658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  39.88 
 
 		 174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  39.88 
 
 		 174 aa  125  5e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.83 
 
 		 163 aa  124  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.83 
 
 		 163 aa  124  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.54 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.74 
 
 		 165 aa  119  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.88 
 
 		 166 aa  118  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0821  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.97 
 
 		 164 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.452585  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  42.36 
 
 		 155 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  42.36 
 
 		 155 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0990  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40 
 
 		 168 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504399  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  40.76 
 
 		 168 aa  108  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.85 
 
 		 159 aa  105  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  39.71 
 
 		 158 aa  104  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0953  NADH dehydrogenase subunit E  38.06 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.544073 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  36.25 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4459  NADH dehydrogenase subunit E  35.98 
 
 		 305 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1960  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.93 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0417  NADH dehydrogenase subunit E  43.07 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1825  NADH dehydrogenase subunit E  43.07 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1439  NADH dehydrogenase subunit E  43.07 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0487171  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0733  NADH dehydrogenase subunit E  43.07 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1134  NADH dehydrogenase subunit E  43.07 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0930546  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1065  NADH dehydrogenase subunit E  43.07 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.331293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1294  NADH dehydrogenase subunit E  43.07 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.27 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1303  NADH dehydrogenase subunit E  43.07 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  35.37 
 
 		 273 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1242  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.91 
 
 		 176 aa  102  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1032  NADH dehydrogenase subunit E  41.01 
 
 		 161 aa  101  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0249192  normal  0.0947418 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1267  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.82 
 
 		 175 aa  101  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1428  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.37 
 
 		 165 aa  101  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.464968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3210  NADH dehydrogenase subunit E  40.29 
 
 		 161 aa  101  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2827  NADH dehydrogenase subunit E  34.52 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.169197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.74 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1505  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.78 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00485138 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1347  NADH dehydrogenase subunit E  39.57 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00701728  normal  0.0175389 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1278  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  31.93 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.468909 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2809  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.13 
 
 		 165 aa  99.8  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2691  NADH dehydrogenase subunit E  36.99 
 
 		 239 aa  99.4  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0273  NADH dehydrogenase subunit E  37.24 
 
 		 175 aa  99.8  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3252  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.97 
 
 		 166 aa  99.8  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2156  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.87 
 
 		 224 aa  99.4  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0876  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.33 
 
 		 163 aa  99.4  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0244  NADH dehydrogenase subunit E  37.24 
 
 		 175 aa  99.4  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0961  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.33 
 
 		 163 aa  99.4  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00643352 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2005  NADH dehydrogenase subunit E  39.57 
 
 		 161 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583559  normal  0.143648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>