More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2922 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2922  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  100 
 
 
264 aa  544  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2395  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  71.36 
 
 
222 aa  335  5e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0717093  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2056  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  61.97 
 
 
457 aa  285  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  65.66 
 
 
385 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4394  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  66.16 
 
 
394 aa  281  9e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4629  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  68.21 
 
 
229 aa  278  8e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  52.96 
 
 
412 aa  272  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1081  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  65.15 
 
 
412 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.320932 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1210  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  65.15 
 
 
412 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3222  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  61.65 
 
 
208 aa  263  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.237944  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0746  NADH dehydrogenase subunit E  57.58 
 
 
398 aa  248  5e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.331264  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2831  NADH dehydrogenase subunit E  60.41 
 
 
228 aa  239  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147014  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1313  NADH dehydrogenase subunit E  56.57 
 
 
402 aa  233  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0324148  normal  0.032376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4558  NADH dehydrogenase subunit E  59.8 
 
 
203 aa  232  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147292 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1176  NADH dehydrogenase subunit E  57.14 
 
 
395 aa  231  9e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1883  NADH dehydrogenase subunit E  58.79 
 
 
250 aa  229  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2406  NADH dehydrogenase subunit E  58.71 
 
 
265 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979437 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1178  NADH dehydrogenase subunit E  56.06 
 
 
303 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3295  NADH dehydrogenase subunit E  57.71 
 
 
249 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2516  NADH dehydrogenase subunit E  56.06 
 
 
303 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2003  NADH dehydrogenase subunit E  56.63 
 
 
303 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277346  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2246  NADH dehydrogenase subunit E  55.5 
 
 
239 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0214593  normal  0.111261 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2216  NADH dehydrogenase subunit E  57.79 
 
 
228 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1359  NADH dehydrogenase subunit E  55.15 
 
 
221 aa  224  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.127402  normal  0.0368394 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0801  NADH dehydrogenase subunit E  55.94 
 
 
237 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0806  NADH dehydrogenase subunit E  55.94 
 
 
237 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2577  NADH dehydrogenase subunit E  49.39 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.251247  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2882  NADH dehydrogenase subunit E  48.79 
 
 
249 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2419  NADH dehydrogenase subunit E  55.45 
 
 
385 aa  218  8.999999999999998e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0893  NADH dehydrogenase subunit E  55.72 
 
 
273 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58748  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1356  NADH dehydrogenase subunit E  55.17 
 
 
388 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1026  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.97 
 
 
345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1717  NADH dehydrogenase subunit E  54.95 
 
 
266 aa  211  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1264  NADH dehydrogenase subunit E  54.19 
 
 
388 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0782  NADH dehydrogenase subunit E  51.72 
 
 
225 aa  205  7e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.916923  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1306  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  52.28 
 
 
222 aa  201  7e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  0.728232 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2986  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  52.82 
 
 
229 aa  199  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0736686  normal  0.383268 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  52.11 
 
 
208 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2296  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.14 
 
 
222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  47.78 
 
 
249 aa  182  3e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  52.44 
 
 
181 aa  177  2e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  48.4 
 
 
260 aa  176  5e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0925  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  48 
 
 
203 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  47.15 
 
 
270 aa  169  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  50.96 
 
 
170 aa  166  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
180 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  43.62 
 
 
239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  45.98 
 
 
181 aa  161  1e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.3 
 
 
216 aa  160  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103945  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  43.83 
 
 
166 aa  156  3e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_7050  predicted protein  40.72 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000378621  hitchhiker  0.000000494703 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.86 
 
 
165 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  41.98 
 
 
174 aa  135  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.89 
 
 
163 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.89 
 
 
163 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.59 
 
 
176 aa  135  8e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  44.59 
 
 
174 aa  135  8e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.81 
 
 
161 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0990  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.27 
 
 
168 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504399  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  42.76 
 
 
155 aa  128  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  42.76 
 
 
155 aa  128  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.38 
 
 
166 aa  128  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1378  NADH dehydrogenase I chain E  39.35 
 
 
177 aa  125  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.41658  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.4 
 
 
166 aa  125  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  40.72 
 
 
175 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0821  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.82 
 
 
164 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.452585  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.1 
 
 
170 aa  118  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2691  NADH dehydrogenase subunit E  36.99 
 
 
239 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  41.25 
 
 
168 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  38.85 
 
 
158 aa  115  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1347  NADH dehydrogenase subunit E  43.57 
 
 
161 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00701728  normal  0.0175389 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1294  NADH dehydrogenase subunit E  40 
 
 
161 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1825  NADH dehydrogenase subunit E  40 
 
 
161 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1439  NADH dehydrogenase subunit E  40 
 
 
161 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0487171  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0733  NADH dehydrogenase subunit E  40 
 
 
161 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0417  NADH dehydrogenase subunit E  40 
 
 
161 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1065  NADH dehydrogenase subunit E  40 
 
 
161 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.331293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1303  NADH dehydrogenase subunit E  40 
 
 
161 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1134  NADH dehydrogenase subunit E  40 
 
 
161 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0930546  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4485  NADH dehydrogenase subunit E  35.34 
 
 
287 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256998  hitchhiker  0.00514085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3083  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.84 
 
 
174 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.71 
 
 
169 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1960  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.1 
 
 
165 aa  112  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1746  NADH dehydrogenase subunit E  39.1 
 
 
159 aa  112  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3210  NADH dehydrogenase subunit E  42.86 
 
 
161 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0273  NADH dehydrogenase subunit E  38.24 
 
 
175 aa  112  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1242  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.16 
 
 
176 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1032  NADH dehydrogenase subunit E  38.12 
 
 
161 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0249192  normal  0.0947418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1881  NADH dehydrogenase subunit E  40.14 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.54783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7687  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.16 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0244  NADH dehydrogenase subunit E  40.79 
 
 
175 aa  110  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1761  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.18 
 
 
170 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5573  NADH dehydrogenase subunit E  37.5 
 
 
161 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0826314  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2162  NADH dehydrogenase subunit E  37.5 
 
 
161 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2269  NADH dehydrogenase subunit E  37.5 
 
 
161 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.128082  normal  0.14114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1633  NADH dehydrogenase subunit E  37.5 
 
 
161 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28470  NADH dehydrogenase subunit E  38.12 
 
 
164 aa  109  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2283  NADH dehydrogenase subunit E  37.5 
 
 
161 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0960667  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2245  NADH dehydrogenase subunit E  37.5 
 
 
161 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254081  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4414  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.92 
 
 
240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>