More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2296 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2296  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  100 
 
 
222 aa  465  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1306  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  74.77 
 
 
222 aa  354  5e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  0.728232 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2986  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  70.27 
 
 
229 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0736686  normal  0.383268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.77 
 
 
385 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3222  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.66 
 
 
208 aa  195  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.237944  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2395  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  48.54 
 
 
222 aa  191  9e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0717093  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  51.09 
 
 
239 aa  191  1e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2922  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.14 
 
 
264 aa  189  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.5 
 
 
412 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  51.3 
 
 
249 aa  186  2e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4629  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.89 
 
 
229 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4394  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.4 
 
 
394 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2056  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.95 
 
 
457 aa  184  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1210  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.5 
 
 
412 aa  184  8e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1081  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.5 
 
 
412 aa  184  8e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.320932 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1313  NADH dehydrogenase subunit E  48.44 
 
 
402 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0324148  normal  0.032376 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  47.21 
 
 
208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0746  NADH dehydrogenase subunit E  48.44 
 
 
398 aa  177  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.331264  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0925  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  49.15 
 
 
203 aa  176  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1026  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.01 
 
 
345 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  47.24 
 
 
270 aa  174  8e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2831  NADH dehydrogenase subunit E  46.63 
 
 
228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147014  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  49.42 
 
 
260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  49.69 
 
 
181 aa  171  5.999999999999999e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1883  NADH dehydrogenase subunit E  46.88 
 
 
250 aa  170  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1178  NADH dehydrogenase subunit E  43.28 
 
 
303 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2516  NADH dehydrogenase subunit E  43.28 
 
 
303 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.36 
 
 
216 aa  168  7e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103945  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0801  NADH dehydrogenase subunit E  47.12 
 
 
237 aa  168  8e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0806  NADH dehydrogenase subunit E  47.12 
 
 
237 aa  168  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
166 aa  167  1e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  48.5 
 
 
180 aa  167  1e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2003  NADH dehydrogenase subunit E  43.75 
 
 
303 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277346  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1359  NADH dehydrogenase subunit E  41.96 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.127402  normal  0.0368394 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  47.27 
 
 
181 aa  166  4e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1356  NADH dehydrogenase subunit E  46.94 
 
 
388 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1717  NADH dehydrogenase subunit E  46.08 
 
 
266 aa  165  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2216  NADH dehydrogenase subunit E  45.31 
 
 
228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2246  NADH dehydrogenase subunit E  42.79 
 
 
239 aa  164  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0214593  normal  0.111261 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  51.23 
 
 
170 aa  163  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2419  NADH dehydrogenase subunit E  45.15 
 
 
385 aa  162  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1264  NADH dehydrogenase subunit E  46.43 
 
 
388 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_7050  predicted protein  44.55 
 
 
217 aa  161  8.000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000378621  hitchhiker  0.000000494703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4558  NADH dehydrogenase subunit E  45.6 
 
 
203 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147292 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0782  NADH dehydrogenase subunit E  43.69 
 
 
225 aa  160  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.916923  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2882  NADH dehydrogenase subunit E  40.81 
 
 
249 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2406  NADH dehydrogenase subunit E  43 
 
 
265 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979437 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2577  NADH dehydrogenase subunit E  44.27 
 
 
249 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.251247  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3295  NADH dehydrogenase subunit E  43.35 
 
 
249 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  48.12 
 
 
161 aa  155  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1176  NADH dehydrogenase subunit E  41.35 
 
 
395 aa  155  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1378  NADH dehydrogenase I chain E  43.48 
 
 
177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.41658  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0893  NADH dehydrogenase subunit E  43.27 
 
 
273 aa  151  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58748  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.18 
 
 
165 aa  149  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  47.33 
 
 
174 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  46.67 
 
 
174 aa  138  6e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.79 
 
 
166 aa  135  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.92 
 
 
163 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.92 
 
 
163 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0821  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.23 
 
 
164 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.452585  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  41.1 
 
 
158 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  42.57 
 
 
155 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  42.57 
 
 
155 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1242  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.24 
 
 
176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3210  NADH dehydrogenase subunit E  41.57 
 
 
161 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  39.43 
 
 
175 aa  124  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  45.33 
 
 
168 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.58 
 
 
169 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0961  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.68 
 
 
163 aa  123  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643352 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0876  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.68 
 
 
163 aa  123  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0965  NADH dehydrogenase subunit E  43.48 
 
 
168 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489365  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1347  NADH dehydrogenase subunit E  40.96 
 
 
161 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00701728  normal  0.0175389 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2005  NADH dehydrogenase subunit E  40.36 
 
 
161 aa  121  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583559  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.24 
 
 
174 aa  121  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1505  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.1 
 
 
175 aa  120  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00485138 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.26 
 
 
176 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1960  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42 
 
 
165 aa  119  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2210  NADH dehydrogenase subunit E  40.57 
 
 
167 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.445986 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.8 
 
 
170 aa  119  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1887  NADH dehydrogenase subunit E  40.57 
 
 
167 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  0.768651 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1267  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.91 
 
 
175 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1303  NADH dehydrogenase subunit E  40.36 
 
 
161 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1825  NADH dehydrogenase subunit E  40.36 
 
 
161 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1439  NADH dehydrogenase subunit E  40.36 
 
 
161 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0487171  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0417  NADH dehydrogenase subunit E  40.36 
 
 
161 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1294  NADH dehydrogenase subunit E  40.36 
 
 
161 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1065  NADH dehydrogenase subunit E  40.36 
 
 
161 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.331293  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.37 
 
 
166 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1134  NADH dehydrogenase subunit E  40.36 
 
 
161 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0930546  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0733  NADH dehydrogenase subunit E  40.36 
 
 
161 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2058  NADH dehydrogenase subunit E  40.24 
 
 
167 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174503  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1746  NADH dehydrogenase subunit E  39.75 
 
 
159 aa  118  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0990  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.89 
 
 
168 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504399  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1633  NADH dehydrogenase subunit E  39.16 
 
 
161 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2283  NADH dehydrogenase subunit E  39.16 
 
 
161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0960667  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2245  NADH dehydrogenase subunit E  39.16 
 
 
161 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254081  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2269  NADH dehydrogenase subunit E  39.16 
 
 
161 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.128082  normal  0.14114 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2162  NADH dehydrogenase subunit E  39.16 
 
 
161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5573  NADH dehydrogenase subunit E  39.16 
 
 
161 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0826314  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0931  NADH dehydrogenase subunit E  41.36 
 
 
168 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>