More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0587 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0587  NADH dehydrogenase subunit E  100 
 
 
169 aa  352  2e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0576  NADH dehydrogenase subunit E  95.86 
 
 
169 aa  342  1e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1696  NADH dehydrogenase subunit E  79.76 
 
 
170 aa  295  2e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.142144  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2567  NADH dehydrogenase subunit E  57.52 
 
 
166 aa  206  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29980  NADH dehydrogenase subunit E  57.52 
 
 
166 aa  206  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4122  NADH dehydrogenase subunit E  57.24 
 
 
165 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2415  NADH dehydrogenase subunit E  59.87 
 
 
170 aa  206  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144111  normal  0.147361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3694  NADH dehydrogenase subunit E  57.24 
 
 
165 aa  205  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0959076  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1870  NADH dehydrogenase subunit E  57.24 
 
 
165 aa  204  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.142581 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1743  NADH dehydrogenase subunit E  57.24 
 
 
165 aa  204  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.048618  normal  0.210443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3606  NADH dehydrogenase subunit E  58.55 
 
 
165 aa  202  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3129  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  57.83 
 
 
171 aa  202  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3368  NADH dehydrogenase I, E subunit  56.21 
 
 
165 aa  200  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3200  NADH dehydrogenase subunit E  57.24 
 
 
165 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333269  normal  0.0237431 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3305  NADH dehydrogenase subunit E  57.89 
 
 
183 aa  198  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00437107  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2829  NADH dehydrogenase subunit E  59.21 
 
 
166 aa  198  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0584484  normal  0.465649 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02210  NADH dehydrogenase subunit E  54.27 
 
 
166 aa  197  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1372  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  54.27 
 
 
166 aa  197  7.999999999999999e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00570397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2434  NADH dehydrogenase subunit E  54.27 
 
 
166 aa  197  7.999999999999999e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02170  hypothetical protein  54.27 
 
 
166 aa  197  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3424  NADH dehydrogenase subunit E  54.27 
 
 
166 aa  197  7.999999999999999e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208277  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1367  NADH dehydrogenase subunit E  54.27 
 
 
166 aa  197  7.999999999999999e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.334565  normal  0.707376 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2661  NADH dehydrogenase subunit E  54.27 
 
 
166 aa  197  7.999999999999999e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0294149  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2439  NADH dehydrogenase subunit E  54.27 
 
 
166 aa  197  7.999999999999999e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2578  NADH dehydrogenase subunit E  54.27 
 
 
166 aa  197  7.999999999999999e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.520034  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28470  NADH dehydrogenase subunit E  56.86 
 
 
164 aa  195  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2464  NADH dehydrogenase subunit E  54.27 
 
 
166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11895  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2509  NADH dehydrogenase subunit E  54.27 
 
 
166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798131  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2671  NADH dehydrogenase subunit E  54.27 
 
 
166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  0.621084 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1563  NADH dehydrogenase subunit E  56.58 
 
 
187 aa  194  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449918  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2564  NADH dehydrogenase subunit E  54.27 
 
 
166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.401608  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2553  NADH dehydrogenase subunit E  54.27 
 
 
166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.788767  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1397  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  56.21 
 
 
176 aa  192  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231323  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2547  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  55.48 
 
 
176 aa  191  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.15313  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2769  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  56.21 
 
 
171 aa  191  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217796  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1495  NADH dehydrogenase subunit E  54.55 
 
 
181 aa  190  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1018  NADH dehydrogenase subunit E  54.9 
 
 
180 aa  185  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0378  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  52.23 
 
 
167 aa  175  3e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.320338  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1124  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  46.41 
 
 
154 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1117  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  51.39 
 
 
165 aa  157  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3822  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.4 
 
 
154 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.144781  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1016  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.1 
 
 
168 aa  150  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.664946  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1356  NADH dehydrogenase subunit E  44.97 
 
 
157 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0103  NADH dehydrogenase subunit E  44.74 
 
 
157 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1739  NADH dehydrogenase subunit E  44.74 
 
 
157 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0207  NADH dehydrogenase subunit E  44.81 
 
 
162 aa  142  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1692  NADH dehydrogenase subunit E  43.42 
 
 
157 aa  141  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175779  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2863  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  42.95 
 
 
179 aa  141  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.088948  hitchhiker  0.00474747 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0715  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  48.87 
 
 
164 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1350  NADH dehydrogenase subunit E  40.97 
 
 
157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.150858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4740  NADH dehydrogenase subunit E  40.28 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871822  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0154  NADH dehydrogenase subunit E  43.85 
 
 
173 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1329  NADH dehydrogenase subunit E  39.58 
 
 
157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116663  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0332  NADH dehydrogenase subunit E  43.51 
 
 
157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4068  NADH dehydrogenase subunit E  39.74 
 
 
157 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50582  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3443  NADH dehydrogenase subunit E  41.48 
 
 
162 aa  123  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1956  NADH dehydrogenase subunit E  37.88 
 
 
163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131976  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0177  NADH dehydrogenase subunit E  38.64 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.67 
 
 
174 aa  110  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0096  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  30.43 
 
 
162 aa  108  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108902 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0159  NADH dehydrogenase subunit E  38.64 
 
 
155 aa  107  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.458445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.73 
 
 
174 aa  107  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  34.44 
 
 
166 aa  105  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1886  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.42 
 
 
159 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0722  formate dehydrogenase subunit gamma  34.25 
 
 
156 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.84 
 
 
165 aa  105  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0158  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  34.46 
 
 
149 aa  105  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  38.56 
 
 
168 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.18 
 
 
163 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.18 
 
 
163 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0617  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  42.5 
 
 
179 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390132  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.29 
 
 
159 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02960  NADH dehydrogenase I subunit E  31.54 
 
 
136 aa  100  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2236  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.77 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0833  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit  33.1 
 
 
163 aa  99.4  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2703  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  35.38 
 
 
151 aa  99.8  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0226  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  38.17 
 
 
155 aa  99.4  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0145  [Fe] hydrogenase, HymA subunit, putative  38.17 
 
 
155 aa  99  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.702609  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06310  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  31.97 
 
 
162 aa  99  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000454733  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  35.48 
 
 
174 aa  98.6  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_153  [Fe] hydrogenase, HymA subunit  38.17 
 
 
155 aa  98.2  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3083  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.53 
 
 
174 aa  98.2  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  35.48 
 
 
174 aa  98.2  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0338  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  31.94 
 
 
165 aa  98.2  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113802  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  31.82 
 
 
155 aa  98.2  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3506  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  31.72 
 
 
163 aa  98.2  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1295  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  34.21 
 
 
160 aa  98.2  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0702  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  28.47 
 
 
186 aa  97.8  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0227  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  33.33 
 
 
157 aa  96.7  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00462802  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0558  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  31.69 
 
 
161 aa  96.7  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.808339  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  31.82 
 
 
155 aa  97.1  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1858  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  33.1 
 
 
160 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0492  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  32.64 
 
 
157 aa  96.7  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1393  formate dehydrogenase subunit gamma  35.38 
 
 
159 aa  96.3  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1032  NADH dehydrogenase subunit E  34.39 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0249192  normal  0.0947418 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  32.28 
 
 
249 aa  96.3  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0367  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.21 
 
 
208 aa  95.9  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1687  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.27 
 
 
153 aa  96.3  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0931  NADH dehydrogenase subunit E  35.77 
 
 
168 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1339  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  34.09 
 
 
155 aa  95.5  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>