More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2863 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2863  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  100 
 
 
179 aa  368  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.088948  hitchhiker  0.00474747 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1124  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  46 
 
 
154 aa  150  7e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3822  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.1 
 
 
154 aa  148  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.144781  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3424  NADH dehydrogenase subunit E  41.94 
 
 
166 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208277  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02210  NADH dehydrogenase subunit E  41.29 
 
 
166 aa  142  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1372  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.29 
 
 
166 aa  142  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00570397  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2439  NADH dehydrogenase subunit E  41.29 
 
 
166 aa  142  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02170  hypothetical protein  41.29 
 
 
166 aa  142  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1016  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  42.77 
 
 
168 aa  142  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.664946  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1367  NADH dehydrogenase subunit E  41.29 
 
 
166 aa  142  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.334565  normal  0.707376 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2661  NADH dehydrogenase subunit E  41.29 
 
 
166 aa  142  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0294149  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2434  NADH dehydrogenase subunit E  41.29 
 
 
166 aa  142  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2578  NADH dehydrogenase subunit E  41.29 
 
 
166 aa  142  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.520034  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1696  NADH dehydrogenase subunit E  44.23 
 
 
170 aa  141  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.142144  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0587  NADH dehydrogenase subunit E  42.95 
 
 
169 aa  141  6e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0576  NADH dehydrogenase subunit E  41.67 
 
 
169 aa  139  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2509  NADH dehydrogenase subunit E  40.65 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798131  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2553  NADH dehydrogenase subunit E  40.65 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.788767  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2464  NADH dehydrogenase subunit E  40.65 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11895  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2564  NADH dehydrogenase subunit E  40.65 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.401608  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2671  NADH dehydrogenase subunit E  40.65 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  0.621084 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2829  NADH dehydrogenase subunit E  40.26 
 
 
166 aa  137  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0584484  normal  0.465649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1563  NADH dehydrogenase subunit E  40 
 
 
187 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449918  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28470  NADH dehydrogenase subunit E  40.51 
 
 
164 aa  136  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2415  NADH dehydrogenase subunit E  39.63 
 
 
170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144111  normal  0.147361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4122  NADH dehydrogenase subunit E  39.24 
 
 
165 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3694  NADH dehydrogenase subunit E  39.24 
 
 
165 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0959076  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1743  NADH dehydrogenase subunit E  39.24 
 
 
165 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.048618  normal  0.210443 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2547  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.61 
 
 
176 aa  134  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.15313  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3305  NADH dehydrogenase subunit E  40 
 
 
183 aa  134  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00437107  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1397  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.94 
 
 
176 aa  133  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231323  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1870  NADH dehydrogenase subunit E  38.61 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.142581 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3606  NADH dehydrogenase subunit E  39.24 
 
 
165 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1356  NADH dehydrogenase subunit E  40.79 
 
 
157 aa  132  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2567  NADH dehydrogenase subunit E  39.24 
 
 
166 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3200  NADH dehydrogenase subunit E  38.22 
 
 
165 aa  130  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333269  normal  0.0237431 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1495  NADH dehydrogenase subunit E  38.04 
 
 
181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29980  NADH dehydrogenase subunit E  38.61 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3368  NADH dehydrogenase I, E subunit  38.22 
 
 
165 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2769  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.34 
 
 
171 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217796  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1117  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.06 
 
 
165 aa  127  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1018  NADH dehydrogenase subunit E  37.27 
 
 
180 aa  124  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3129  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.5 
 
 
171 aa  121  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1692  NADH dehydrogenase subunit E  44.2 
 
 
157 aa  121  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175779  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1350  NADH dehydrogenase subunit E  40.91 
 
 
157 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.150858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4740  NADH dehydrogenase subunit E  43.7 
 
 
162 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871822  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1329  NADH dehydrogenase subunit E  39.35 
 
 
157 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116663  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0378  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.08 
 
 
167 aa  120  9.999999999999999e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.320338  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0103  NADH dehydrogenase subunit E  43.48 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1739  NADH dehydrogenase subunit E  43.48 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4068  NADH dehydrogenase subunit E  43.17 
 
 
157 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50582  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0715  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  40.69 
 
 
164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0332  NADH dehydrogenase subunit E  37.8 
 
 
157 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0207  NADH dehydrogenase subunit E  36.36 
 
 
162 aa  108  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2058  NADH dehydrogenase subunit E  37.42 
 
 
167 aa  104  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174503  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1887  NADH dehydrogenase subunit E  36.31 
 
 
167 aa  104  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  0.768651 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3443  NADH dehydrogenase subunit E  37.14 
 
 
162 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0154  NADH dehydrogenase subunit E  35.1 
 
 
173 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2210  NADH dehydrogenase subunit E  36.31 
 
 
167 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.445986 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.93 
 
 
174 aa  101  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0965  NADH dehydrogenase subunit E  38.06 
 
 
168 aa  101  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489365  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  36.13 
 
 
175 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1956  NADH dehydrogenase subunit E  33.57 
 
 
163 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131976  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.56 
 
 
176 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.93 
 
 
174 aa  99.8  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.78 
 
 
163 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0931  NADH dehydrogenase subunit E  36.94 
 
 
168 aa  99.8  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.78 
 
 
163 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0096  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.67 
 
 
162 aa  99.4  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108902 
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  32.28 
 
 
166 aa  97.8  8e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.03 
 
 
248 aa  97.1  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.941311 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1267  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.91 
 
 
175 aa  97.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  33.11 
 
 
155 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  34.97 
 
 
155 aa  95.5  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  31.85 
 
 
165 aa  95.5  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1247  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  32.9 
 
 
158 aa  95.5  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0560002  normal  0.0336661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7687  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.89 
 
 
228 aa  95.5  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0876  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.37 
 
 
163 aa  94.4  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0961  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.37 
 
 
163 aa  94.4  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643352 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0953  NADH dehydrogenase subunit E  36.72 
 
 
157 aa  93.6  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.544073 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1886  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.75 
 
 
159 aa  93.6  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.67 
 
 
159 aa  94  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1045  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  33.12 
 
 
230 aa  93.6  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1746  NADH dehydrogenase subunit E  34.19 
 
 
159 aa  93.2  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  32.69 
 
 
158 aa  92  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02960  NADH dehydrogenase I subunit E  35.96 
 
 
136 aa  92  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0177  NADH dehydrogenase subunit E  37.82 
 
 
156 aa  92  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1687  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.62 
 
 
153 aa  92  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  33.33 
 
 
168 aa  91.7  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  33.56 
 
 
174 aa  91.3  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3083  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  32.69 
 
 
174 aa  91.3  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  33.56 
 
 
174 aa  91.3  7e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0524  NADH dehydrogenase subunit E  31.25 
 
 
263 aa  91.3  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0285  NADH-quinone oxidoreductase subunit E  33.8 
 
 
231 aa  91.3  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2005  NADH dehydrogenase subunit E  34.59 
 
 
161 aa  90.9  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583559  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0159  NADH dehydrogenase subunit E  34.75 
 
 
155 aa  90.9  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.458445 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1924  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  31.17 
 
 
172 aa  90.1  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.362282  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2691  NADH dehydrogenase subunit E  32.39 
 
 
239 aa  90.1  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1505  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.36 
 
 
175 aa  89.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00485138 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0226  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  31.61 
 
 
155 aa  89.4  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>