More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3129 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_3129  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  100 
 
 
171 aa  348  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29980  NADH dehydrogenase subunit E  60.98 
 
 
166 aa  210  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2567  NADH dehydrogenase subunit E  60.98 
 
 
166 aa  209  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2415  NADH dehydrogenase subunit E  60 
 
 
170 aa  207  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144111  normal  0.147361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1743  NADH dehydrogenase subunit E  60.12 
 
 
165 aa  205  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.048618  normal  0.210443 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0576  NADH dehydrogenase subunit E  57.83 
 
 
169 aa  204  4e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4122  NADH dehydrogenase subunit E  60.12 
 
 
165 aa  204  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1870  NADH dehydrogenase subunit E  60.12 
 
 
165 aa  203  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.142581 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3694  NADH dehydrogenase subunit E  60.12 
 
 
165 aa  204  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0959076  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0587  NADH dehydrogenase subunit E  57.83 
 
 
169 aa  202  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3606  NADH dehydrogenase subunit E  59.51 
 
 
165 aa  202  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3305  NADH dehydrogenase subunit E  62.03 
 
 
183 aa  202  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00437107  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1563  NADH dehydrogenase subunit E  59.65 
 
 
187 aa  202  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449918  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1397  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  56.8 
 
 
176 aa  201  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231323  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28470  NADH dehydrogenase subunit E  62.89 
 
 
164 aa  201  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3368  NADH dehydrogenase I, E subunit  60.38 
 
 
165 aa  201  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3200  NADH dehydrogenase subunit E  59.75 
 
 
165 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333269  normal  0.0237431 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2829  NADH dehydrogenase subunit E  62.42 
 
 
166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0584484  normal  0.465649 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2671  NADH dehydrogenase subunit E  61.78 
 
 
166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  0.621084 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2509  NADH dehydrogenase subunit E  61.78 
 
 
166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798131  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2564  NADH dehydrogenase subunit E  61.78 
 
 
166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.401608  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2553  NADH dehydrogenase subunit E  61.78 
 
 
166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.788767  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2464  NADH dehydrogenase subunit E  61.78 
 
 
166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1495  NADH dehydrogenase subunit E  62.82 
 
 
181 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1018  NADH dehydrogenase subunit E  61.69 
 
 
180 aa  196  9e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3424  NADH dehydrogenase subunit E  61.15 
 
 
166 aa  196  9e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208277  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2769  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  59.87 
 
 
171 aa  196  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217796  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02210  NADH dehydrogenase subunit E  61.15 
 
 
166 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1372  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  61.15 
 
 
166 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00570397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2434  NADH dehydrogenase subunit E  61.15 
 
 
166 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02170  hypothetical protein  61.15 
 
 
166 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2439  NADH dehydrogenase subunit E  61.15 
 
 
166 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2661  NADH dehydrogenase subunit E  61.15 
 
 
166 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0294149  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1367  NADH dehydrogenase subunit E  61.15 
 
 
166 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.334565  normal  0.707376 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2578  NADH dehydrogenase subunit E  61.15 
 
 
166 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.520034  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2547  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  56.14 
 
 
176 aa  193  7e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.15313  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1696  NADH dehydrogenase subunit E  53.53 
 
 
170 aa  187  8e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.142144  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0378  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  55.84 
 
 
167 aa  185  2e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.320338  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1124  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  53.59 
 
 
154 aa  176  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3822  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  52.6 
 
 
154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.144781  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1117  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  59.7 
 
 
165 aa  169  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1356  NADH dehydrogenase subunit E  50.99 
 
 
157 aa  163  9e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1016  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  50.33 
 
 
168 aa  162  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.664946  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1329  NADH dehydrogenase subunit E  49.32 
 
 
157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116663  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4740  NADH dehydrogenase subunit E  49.32 
 
 
162 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871822  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0103  NADH dehydrogenase subunit E  52.05 
 
 
157 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1350  NADH dehydrogenase subunit E  50 
 
 
157 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.150858 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1692  NADH dehydrogenase subunit E  52.52 
 
 
157 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175779  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1739  NADH dehydrogenase subunit E  52.05 
 
 
157 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4068  NADH dehydrogenase subunit E  47.71 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50582  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0207  NADH dehydrogenase subunit E  43.51 
 
 
162 aa  131  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0332  NADH dehydrogenase subunit E  46.92 
 
 
157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0715  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  49.63 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0154  NADH dehydrogenase subunit E  44.06 
 
 
173 aa  124  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1956  NADH dehydrogenase subunit E  39.19 
 
 
163 aa  124  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131976  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3443  NADH dehydrogenase subunit E  42.67 
 
 
162 aa  123  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2863  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  37.5 
 
 
179 aa  121  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.088948  hitchhiker  0.00474747 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.42 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.42 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0177  NADH dehydrogenase subunit E  40.15 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  38.31 
 
 
260 aa  114  8.999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0159  NADH dehydrogenase subunit E  40.91 
 
 
155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.458445 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  39.73 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  39.73 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0096  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.96 
 
 
162 aa  110  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108902 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  41.94 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2236  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.1 
 
 
163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0342  NADH dehydrogenase I, E subunit  33.73 
 
 
173 aa  108  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.702916  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0656  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  37.01 
 
 
182 aa  106  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0027799  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0158  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  40.31 
 
 
149 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.31 
 
 
169 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3922  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  34.46 
 
 
169 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3134  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  34.38 
 
 
171 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0282366  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.66 
 
 
159 aa  104  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4006  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  33.78 
 
 
168 aa  104  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.7952e-27 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.34 
 
 
170 aa  103  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  36.94 
 
 
270 aa  103  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0367  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.81 
 
 
208 aa  103  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2156  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.4 
 
 
224 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0617  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  43.09 
 
 
179 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390132  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3506  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.33 
 
 
163 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0227  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  35.29 
 
 
157 aa  102  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00462802  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0916  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  33.09 
 
 
162 aa  102  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1339  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  37.98 
 
 
155 aa  102  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4240  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  33.56 
 
 
168 aa  101  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1633  NADH dehydrogenase subunit E  37.66 
 
 
161 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.1 
 
 
166 aa  101  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2245  NADH dehydrogenase subunit E  37.66 
 
 
161 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254081  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2269  NADH dehydrogenase subunit E  37.66 
 
 
161 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.128082  normal  0.14114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3351  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  33.11 
 
 
173 aa  101  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.044773 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2162  NADH dehydrogenase subunit E  37.66 
 
 
161 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2283  NADH dehydrogenase subunit E  37.66 
 
 
161 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0960667  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1746  NADH dehydrogenase subunit E  39.42 
 
 
159 aa  100  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02960  NADH dehydrogenase I subunit E  34.96 
 
 
136 aa  100  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  38.85 
 
 
168 aa  100  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0833  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit  36.69 
 
 
163 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5573  NADH dehydrogenase subunit E  37.66 
 
 
161 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0826314  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  35.71 
 
 
158 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06310  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  36.89 
 
 
162 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000454733  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  37.93 
 
 
181 aa  100  1e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>