More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3305 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3305  NADH dehydrogenase subunit E  100 
 
 
183 aa  383  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00437107  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1563  NADH dehydrogenase subunit E  84.41 
 
 
187 aa  327  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449918  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1397  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  84.66 
 
 
176 aa  314  5e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231323  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2547  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  81.82 
 
 
176 aa  305  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.15313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1495  NADH dehydrogenase subunit E  78.69 
 
 
181 aa  300  5.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2829  NADH dehydrogenase subunit E  88.82 
 
 
166 aa  300  6.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0584484  normal  0.465649 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2564  NADH dehydrogenase subunit E  87.58 
 
 
166 aa  299  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.401608  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2464  NADH dehydrogenase subunit E  87.58 
 
 
166 aa  299  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11895  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2553  NADH dehydrogenase subunit E  87.58 
 
 
166 aa  299  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.788767  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2509  NADH dehydrogenase subunit E  87.58 
 
 
166 aa  299  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798131  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2671  NADH dehydrogenase subunit E  87.58 
 
 
166 aa  299  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  0.621084 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3424  NADH dehydrogenase subunit E  86.96 
 
 
166 aa  298  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208277  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02210  NADH dehydrogenase subunit E  86.96 
 
 
166 aa  298  4e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1372  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  86.96 
 
 
166 aa  298  4e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00570397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1367  NADH dehydrogenase subunit E  86.96 
 
 
166 aa  298  4e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.334565  normal  0.707376 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2578  NADH dehydrogenase subunit E  86.96 
 
 
166 aa  298  4e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.520034  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02170  hypothetical protein  86.96 
 
 
166 aa  298  4e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2439  NADH dehydrogenase subunit E  86.96 
 
 
166 aa  298  4e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2661  NADH dehydrogenase subunit E  86.96 
 
 
166 aa  298  4e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0294149  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2434  NADH dehydrogenase subunit E  86.96 
 
 
166 aa  298  4e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2769  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  85.35 
 
 
171 aa  292  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28470  NADH dehydrogenase subunit E  75.64 
 
 
164 aa  248  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29980  NADH dehydrogenase subunit E  72.44 
 
 
166 aa  245  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4122  NADH dehydrogenase subunit E  71.79 
 
 
165 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2567  NADH dehydrogenase subunit E  71.79 
 
 
166 aa  244  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3694  NADH dehydrogenase subunit E  71.79 
 
 
165 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0959076  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1743  NADH dehydrogenase subunit E  71.79 
 
 
165 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.048618  normal  0.210443 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1870  NADH dehydrogenase subunit E  71.15 
 
 
165 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.142581 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3606  NADH dehydrogenase subunit E  70.51 
 
 
165 aa  241  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1018  NADH dehydrogenase subunit E  68.26 
 
 
180 aa  240  7.999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2415  NADH dehydrogenase subunit E  70.51 
 
 
170 aa  237  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144111  normal  0.147361 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3200  NADH dehydrogenase subunit E  67.28 
 
 
165 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333269  normal  0.0237431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3368  NADH dehydrogenase I, E subunit  67.28 
 
 
165 aa  234  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0378  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  71.43 
 
 
167 aa  233  1.0000000000000001e-60  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.320338  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3129  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  62.03 
 
 
171 aa  202  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0576  NADH dehydrogenase subunit E  58.55 
 
 
169 aa  202  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0587  NADH dehydrogenase subunit E  57.89 
 
 
169 aa  198  3e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1696  NADH dehydrogenase subunit E  55.92 
 
 
170 aa  193  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.142144  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1016  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  51.63 
 
 
168 aa  167  6e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.664946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1124  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  50.33 
 
 
154 aa  167  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3822  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  50.66 
 
 
154 aa  166  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.144781  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1117  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  51.35 
 
 
165 aa  160  6e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1356  NADH dehydrogenase subunit E  44.97 
 
 
157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0332  NADH dehydrogenase subunit E  46.21 
 
 
157 aa  135  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2863  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  40 
 
 
179 aa  134  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.088948  hitchhiker  0.00474747 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0715  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  44.44 
 
 
164 aa  132  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4740  NADH dehydrogenase subunit E  39.22 
 
 
162 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3443  NADH dehydrogenase subunit E  44.19 
 
 
162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0154  NADH dehydrogenase subunit E  42.96 
 
 
173 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1350  NADH dehydrogenase subunit E  39.87 
 
 
157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.150858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1329  NADH dehydrogenase subunit E  39.22 
 
 
157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116663  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1956  NADH dehydrogenase subunit E  39.86 
 
 
163 aa  125  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131976  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1692  NADH dehydrogenase subunit E  42.22 
 
 
157 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175779  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1739  NADH dehydrogenase subunit E  42.54 
 
 
157 aa  121  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0103  NADH dehydrogenase subunit E  42.54 
 
 
157 aa  121  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0096  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38 
 
 
162 aa  120  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108902 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0207  NADH dehydrogenase subunit E  41.67 
 
 
162 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0158  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  41.86 
 
 
149 aa  120  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3506  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.26 
 
 
163 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1886  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.5 
 
 
159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4068  NADH dehydrogenase subunit E  35.95 
 
 
157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50582  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  38.71 
 
 
155 aa  115  5e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  40.43 
 
 
155 aa  114  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0177  NADH dehydrogenase subunit E  39.1 
 
 
156 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1396  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  38.31 
 
 
160 aa  111  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000129626  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1025  Fe-hydrogenase, gamma subunit  38.41 
 
 
148 aa  111  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.49 
 
 
169 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0833  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit  38.85 
 
 
163 aa  108  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  34.71 
 
 
260 aa  108  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.67 
 
 
163 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.67 
 
 
163 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2156  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35 
 
 
224 aa  107  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1687  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  48.18 
 
 
153 aa  106  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0492  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  38.03 
 
 
157 aa  105  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1829  Fe-hydrogenase, gamma subunit  38.41 
 
 
148 aa  105  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2703  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  36.11 
 
 
151 aa  105  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02960  NADH dehydrogenase I subunit E  35.77 
 
 
136 aa  105  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0916  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  33.81 
 
 
162 aa  105  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1247  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  34.97 
 
 
158 aa  104  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0560002  normal  0.0336661 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_153  [Fe] hydrogenase, HymA subunit  36.57 
 
 
155 aa  104  7e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0159  NADH dehydrogenase subunit E  39.1 
 
 
155 aa  104  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.458445 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1339  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  34.48 
 
 
155 aa  104  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0227  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  35.37 
 
 
157 aa  103  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00462802  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0338  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  34.34 
 
 
165 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113802  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2236  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.23 
 
 
163 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0558  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  35.21 
 
 
161 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.808339  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.36 
 
 
174 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0145  [Fe] hydrogenase, HymA subunit, putative  35.82 
 
 
155 aa  102  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.702609  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0226  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  35.82 
 
 
155 aa  102  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0806  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  38.3 
 
 
149 aa  101  5e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.91557  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  32.91 
 
 
239 aa  101  5e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24660  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit  31.54 
 
 
162 aa  101  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0165  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  35.51 
 
 
175 aa  101  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0632  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.52 
 
 
154 aa  101  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1627  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.52 
 
 
154 aa  101  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3189  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.52 
 
 
154 aa  101  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0176  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  35.29 
 
 
165 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  36.75 
 
 
168 aa  100  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2922  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.67 
 
 
264 aa  99.8  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1653  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  34.62 
 
 
158 aa  99.4  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0145582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>