57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3827 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3827  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  480  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.290909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3059  hypothetical protein  64.95 
 
 		 626 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2056  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  65.38 
 
 		 457 aa  111  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  64.94 
 
 		 412 aa  108  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0746  NADH dehydrogenase subunit E  55.17 
 
 		 398 aa  98.2  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.331264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1081  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  62.34 
 
 		 412 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.320932 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1210  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  62.34 
 
 		 412 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1177  hypothetical protein  53.01 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0930686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1723  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 		 446 aa  90.1  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1789  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 		 440 aa  89.7  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2419  NADH dehydrogenase subunit E  51.95 
 
 		 385 aa  89.7  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2643  hypothetical protein  28.93 
 
 		 219 aa  88.6  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1197  hypothetical protein  42.48 
 
 		 209 aa  88.2  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1313  NADH dehydrogenase subunit E  47.56 
 
 		 402 aa  85.9  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0324148  normal  0.032376 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1176  NADH dehydrogenase subunit E  53.33 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1264  NADH dehydrogenase subunit E  53.12 
 
 		 388 aa  82  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1114  ABC transporter related  52.94 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0650865  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  51.25 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0642  hypothetical protein  47.19 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0637  hypothetical protein  47.19 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1356  NADH dehydrogenase subunit E  51.56 
 
 		 388 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1314  hypothetical protein  43.37 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0719888  normal  0.0263324 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  53.03 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1266  hypothetical protein  36.6 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1731  hypothetical protein  53.33 
 
 		 163 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1358  putative protein in NADH-ubiquinone oxidoreductase complex  53.97 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1732  hypothetical protein  49.21 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2223  30S ribosomal protein S2  51.39 
 
 		 361 aa  67  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1719  hypothetical protein  46.67 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1698  30S ribosomal protein S2  43.88 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1694  30S ribosomal protein S2  50.79 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.754731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3450  30S ribosomal protein S2  46.15 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0387566  normal  0.644555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4827  30S ribosomal protein S2  41.84 
 
 		 349 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356192  normal  0.0170734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3637  hypothetical protein  47.76 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977304  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09026  hypothetical protein  45.45 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0409768  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0895  putative NADH dehydrogenase I chain E  47.54 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.256372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2245  hypothetical protein  47.37 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0103239  normal  0.10945 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4439  30S ribosomal protein S2  42.19 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000842833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2033  30S ribosomal protein S2  43.08 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0655537 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3103  hypothetical protein  50.77 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2782  hypothetical protein  44.62 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.742585  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2073  30S ribosomal protein S2  42.62 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.193389  normal  0.160852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2347  30S ribosomal protein S2  42.62 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.473707 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  42.65 
 
 		 593 aa  55.8  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2828  30S ribosomal protein S2  35 
 
 		 331 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00696653  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3150  hypothetical protein  42.17 
 
 		 167 aa  52.4  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4517  30S ribosomal protein S2  42.86 
 
 		 330 aa  52.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1694  30S ribosomal protein S2  40.91 
 
 		 332 aa  52  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1859  30S ribosomal protein S2  40.91 
 
 		 332 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.113122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2436  30S ribosomal protein S2  40.91 
 
 		 334 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2857  30S ribosomal protein S2  40 
 
 		 331 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  0.180299 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5828  hypothetical protein  40.62 
 
 		 535 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1117  NADH dehydrogenase I chain E  37.31 
 
 		 211 aa  46.6  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.160144  normal  0.345455 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3268  30S ribosomal protein S2  40 
 
 		 331 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138284  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0777  hypothetical protein  39.39 
 
 		 517 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2652  hypothetical protein  43.21 
 
 		 437 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1732  PASTA domain containing protein  40.32 
 
 		 430 aa  42.4  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.186477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>