52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3103 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3103  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  358  2e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2782  hypothetical protein  59.74 
 
 		 193 aa  98.2  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.742585  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1358  putative protein in NADH-ubiquinone oxidoreductase complex  41.73 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1266  hypothetical protein  44.63 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0746  NADH dehydrogenase subunit E  52.44 
 
 		 398 aa  79.7  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.331264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3150  hypothetical protein  51.28 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1313  NADH dehydrogenase subunit E  48.05 
 
 		 402 aa  78.2  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0324148  normal  0.032376 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1177  hypothetical protein  43.53 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0930686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1314  hypothetical protein  38.82 
 
 		 239 aa  71.2  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0719888  normal  0.0263324 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1264  NADH dehydrogenase subunit E  42.67 
 
 		 388 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3827  hypothetical protein  48.19 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.290909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  45 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2245  hypothetical protein  40 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0103239  normal  0.10945 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1176  NADH dehydrogenase subunit E  35.98 
 
 		 395 aa  64.7  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1719  hypothetical protein  36.3 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1356  NADH dehydrogenase subunit E  41.33 
 
 		 388 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2419  NADH dehydrogenase subunit E  34.62 
 
 		 385 aa  62  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  52.94 
 
 		 221 aa  61.2  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0895  putative NADH dehydrogenase I chain E  45.45 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.256372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2056  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.33 
 
 		 457 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3059  hypothetical protein  43.48 
 
 		 626 aa  58.9  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1114  ABC transporter related  42.86 
 
 		 453 aa  58.5  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0650865  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3637  hypothetical protein  47.06 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977304  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_004310  BR1789  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 		 440 aa  58.5  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1723  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 		 446 aa  58.5  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1732  hypothetical protein  38.46 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0777  hypothetical protein  42.65 
 
 		 517 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1731  hypothetical protein  41.79 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2643  hypothetical protein  32.82 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0642  hypothetical protein  41.43 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0637  hypothetical protein  41.43 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1117  NADH dehydrogenase I chain E  47.54 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.160144  normal  0.345455 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4827  30S ribosomal protein S2  41.35 
 
 		 349 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356192  normal  0.0170734 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09026  hypothetical protein  25 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0409768  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.29 
 
 		 412 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1698  30S ribosomal protein S2  40.38 
 
 		 349 aa  52  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5828  hypothetical protein  38.46 
 
 		 535 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1197  hypothetical protein  38.16 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1210  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.9 
 
 		 412 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1081  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.9 
 
 		 412 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.320932 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  38.75 
 
 		 2449 aa  49.3  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  36.76 
 
 		 593 aa  48.9  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2033  30S ribosomal protein S2  39 
 
 		 354 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0655537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2347  30S ribosomal protein S2  37.04 
 
 		 355 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.473707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2073  30S ribosomal protein S2  37.04 
 
 		 355 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.193389  normal  0.160852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1567  hypothetical protein  34.53 
 
 		 431 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3450  30S ribosomal protein S2  41.25 
 
 		 355 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0387566  normal  0.644555 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  32.46 
 
 		 1253 aa  46.2  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  37.1 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3461  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  47.5 
 
 		 230 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2589  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2223  30S ribosomal protein S2  41.94 
 
 		 361 aa  42.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1694  30S ribosomal protein S2  35.64 
 
 		 349 aa  42  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.754731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>