More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2784 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  100 
 
 		 223 aa  431  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  43.86 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  46.88 
 
 		 198 aa  145  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  61.39 
 
 		 124 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 		 105 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3461  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  44.89 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2589  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  51.59 
 
 		 157 aa  129  3e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 		 105 aa  128  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  59.05 
 
 		 129 aa  128  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  58.1 
 
 		 142 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  58.1 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  54.13 
 
 		 171 aa  123  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 104 aa  123  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  52.88 
 
 		 104 aa  120  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 102 aa  118  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  61.22 
 
 		 100 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 103 aa  112  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  52.83 
 
 		 140 aa  112  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 125 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 102 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 104 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  109  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 136 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 104 aa  108  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 104 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  50.49 
 
 		 103 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  48.54 
 
 		 104 aa  106  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  53.47 
 
 		 101 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  46.21 
 
 		 131 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 102 aa  106  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  33.01 
 
 		 208 aa  106  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  44.44 
 
 		 131 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 104 aa  105  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 105 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4922  50S ribosomal protein L21  54.17 
 
 		 130 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0179671  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 102 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  102  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4414  50S ribosomal protein L21  54.17 
 
 		 130 aa  101  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4877  50S ribosomal protein L21  54.17 
 
 		 130 aa  101  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  102  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  48.94 
 
 		 103 aa  101  9e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  47.57 
 
 		 103 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 114 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  100  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  42.45 
 
 		 106 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  99.8  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  99.4  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  99.4  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  99.4  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  99  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 104 aa  99  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 104 aa  98.6  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 101 aa  98.2  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  97.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3195  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  97.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  9.73006e-17  unclonable  7.71694e-24 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  97.4  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  96.3  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 104 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  46.23 
 
 		 258 aa  96.3  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3738  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  95.9  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000915025  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 102 aa  95.5  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  95.5  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  42.72 
 
 		 103 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  95.9  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  95.9  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  95.9  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  95.5  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  95.1  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  95.1  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  94.4  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  94.4  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 146 aa  93.6  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  93.6  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  94  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  45.05 
 
 		 103 aa  93.6  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>