More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3352 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  100 
 
 		 101 aa  197  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  60.78 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 104 aa  105  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  53.47 
 
 		 223 aa  105  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1584  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  53.47 
 
 		 100 aa  103  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1119  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1527  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  50 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  54 
 
 		 188 aa  101  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  52.48 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  54 
 
 		 129 aa  100  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 102 aa  100  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  54 
 
 		 142 aa  100  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 103 aa  100  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 103 aa  100  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  100  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  52.48 
 
 		 198 aa  99.8  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 102 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  98.6  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 102 aa  98.6  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  98.2  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 171 aa  97.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 125 aa  97.4  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 115 aa  97.4  7e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 102 aa  97.1  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 102 aa  97.1  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  51.49 
 
 		 221 aa  96.7  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  54.08 
 
 		 157 aa  96.7  9e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 104 aa  97.1  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 136 aa  96.7  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 115 aa  96.7  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  46.08 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  94.4  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4328  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.665904 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 131 aa  94  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  93.6  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 124 aa  93.6  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  46.53 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 102 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 102 aa  92.8  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  92  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4182  50S ribosomal protein L21  53.54 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 105 aa  90.5  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 140 aa  90.5  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4313  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 101 aa  90.1  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  47.52 
 
 		 258 aa  90.5  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>