More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3283 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
125 aa  250  4.0000000000000004e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  78.64 
 
 
103 aa  169  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 
105 aa  130  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 
105 aa  130  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  51.61 
 
 
157 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  59.41 
 
 
124 aa  128  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 
104 aa  127  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  63.37 
 
 
142 aa  127  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  63.37 
 
 
188 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  60.95 
 
 
129 aa  124  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  50.41 
 
 
136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  57.84 
 
 
103 aa  117  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  48.76 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4723  50S ribosomal protein L21  65.38 
 
 
105 aa  114  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  52.59 
 
 
198 aa  114  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  50.43 
 
 
223 aa  115  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  47.93 
 
 
131 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 
104 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  52.83 
 
 
258 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  53.27 
 
 
221 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  51.46 
 
 
104 aa  111  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4922  50S ribosomal protein L21  59.09 
 
 
130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0179671  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  56.44 
 
 
100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  47.33 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  50.42 
 
 
171 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4877  50S ribosomal protein L21  59.09 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4414  50S ribosomal protein L21  59.09 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3461  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  58.68 
 
 
230 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2589  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4210  50S ribosomal protein L21  63.46 
 
 
105 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0108  50S ribosomal protein L21  64.42 
 
 
104 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.111218 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
102 aa  103  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
102 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  44.55 
 
 
104 aa  101  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
102 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  49.04 
 
 
104 aa  100  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  44.66 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  40.65 
 
 
208 aa  99.4  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
102 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  51.49 
 
 
101 aa  99  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  44.66 
 
 
104 aa  98.2  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
102 aa  97.4  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
105 aa  96.3  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  41.59 
 
 
224 aa  95.5  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  45.63 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0589  50S ribosomal protein L21  56.36 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
102 aa  94.7  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  44.55 
 
 
102 aa  94.7  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 
103 aa  94.4  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4328  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
138 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.665904 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
102 aa  94  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0439  50S ribosomal protein L21  52.78 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
102 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
104 aa  92.8  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0153  50S ribosomal protein L21  52.29 
 
 
132 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4335  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0427  50S ribosomal protein L21  52.78 
 
 
127 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518139  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  48.51 
 
 
102 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4313  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  91.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  48.08 
 
 
104 aa  91.7  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4182  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0246  50S ribosomal protein L21  53.64 
 
 
128 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  92  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  48.08 
 
 
104 aa  92  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  90.9  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
102 aa  90.9  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
103 aa  90.9  6e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  90.5  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  90.5  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  46.53 
 
 
103 aa  90.5  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0514  50S ribosomal protein L21  51.85 
 
 
128 aa  90.1  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  90.5  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0086  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 
104 aa  90.1  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109341  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0484  ribosomal protein L21  43.69 
 
 
105 aa  89.4  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.239256  normal  0.0811402 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0497  ribosomal protein L21  47.52 
 
 
98 aa  89.7  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
102 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2142  ribosomal protein L21  57.27 
 
 
124 aa  89.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  89.4  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0151  50S ribosomal protein L21  47.86 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.772781  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1340  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
102 aa  89.4  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0383215  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  89  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1416  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
102 aa  89  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  89  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
106 aa  89  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  41.75 
 
 
114 aa  88.2  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 
115 aa  88.2  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 
104 aa  88.6  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  46 
 
 
99 aa  88.2  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000107304  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  87.8  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  38.89 
 
 
115 aa  87.8  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  42.72 
 
 
103 aa  87.4  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
103 aa  87.8  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  45.19 
 
 
156 aa  87.4  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>