More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3869 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 105 aa  208  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  99.05 
 
 		 105 aa  207  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  89.42 
 
 		 104 aa  186  9e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  80.2 
 
 		 124 aa  168  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  67.65 
 
 		 142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  67.65 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  63.73 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  66.67 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  60.4 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  58.25 
 
 		 223 aa  128  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  56.19 
 
 		 221 aa  124  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  59.05 
 
 		 198 aa  124  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  54.29 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  58.65 
 
 		 104 aa  120  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  53.33 
 
 		 131 aa  120  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  53.33 
 
 		 131 aa  120  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  56.31 
 
 		 103 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 102 aa  118  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 103 aa  116  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3461  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  67.65 
 
 		 230 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2589  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  56.73 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  52.88 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  52.88 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  59.6 
 
 		 100 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  47.12 
 
 		 104 aa  113  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4723  50S ribosomal protein L21  66.67 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  51.43 
 
 		 258 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4210  50S ribosomal protein L21  67.62 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  54.81 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 102 aa  110  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 102 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4922  50S ribosomal protein L21  61.54 
 
 		 130 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0179671  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  51.46 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0108  50S ribosomal protein L21  65.38 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.111218 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  52.88 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4877  50S ribosomal protein L21  59.62 
 
 		 130 aa  107  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4414  50S ribosomal protein L21  59.62 
 
 		 130 aa  107  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  50.49 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  103  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 104 aa  103  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 103 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 102 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  103  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3738  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000915025  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  100  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  48.54 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  47.57 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0497  ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 98 aa  99.8  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  99.4  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  98.6  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0502  ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1008  50S ribosomal protein L21P  49.5 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>