More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3315 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  100 
 
 		 103 aa  202  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  81.55 
 
 		 114 aa  166  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  66.99 
 
 		 103 aa  138  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 		 103 aa  136  8.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  62.14 
 
 		 103 aa  135  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  62.14 
 
 		 103 aa  135  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  62.38 
 
 		 104 aa  133  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  66.34 
 
 		 104 aa  132  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  61.39 
 
 		 103 aa  127  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  58.42 
 
 		 105 aa  118  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 		 102 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 		 102 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  60.19 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  54.81 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 104 aa  114  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  62.14 
 
 		 103 aa  115  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 		 102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 		 102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 		 102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 		 102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 		 102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 		 102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 		 102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 		 102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  57.43 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  48.54 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 102 aa  105  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0957  50S ribosomal protein L21P  51 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000239901  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  54 
 
 		 99 aa  106  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000107304  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  53.85 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1751  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000842566  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 101 aa  103  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000486349  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  47.57 
 
 		 103 aa  103  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0205  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 100 aa  101  3e-21  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1340  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0383215  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0502  ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 102 aa  100  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  100  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1211  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 102 aa  100  7e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816286  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 102 aa  100  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  45.63 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1538  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 102 aa  100  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  98.6  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  99.4  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf326  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 101 aa  98.6  3e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.858976  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 104 aa  98.2  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  98.2  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2001  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 120 aa  97.4  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536247  normal  0.99837 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 104 aa  97.4  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 102 aa  97.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl441  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 99 aa  97.1  7e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304369  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  45.63 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 102 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 105 aa  97.1  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0098  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 102 aa  96.7  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  45.63 
 
 		 103 aa  96.7  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0089  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199465  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 102 aa  95.9  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0129  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  51.02 
 
 		 100 aa  96.7  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0484  ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.239256  normal  0.0811402 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 208 aa  96.3  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1704  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000276664  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1737  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000015429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 102 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>