More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2001 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2001  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 120 aa  241  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536247  normal  0.99837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2695  50S ribosomal protein L21  85.83 
 
 		 120 aa  205  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  71.57 
 
 		 103 aa  142  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2670  50S ribosomal protein L21  65.69 
 
 		 123 aa  134  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000122926  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  51 
 
 		 102 aa  100  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 103 aa  100  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  49 
 
 		 101 aa  99.4  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1107  ribosomal protein L21  44.74 
 
 		 134 aa  99  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212125  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1325  50S ribosomal protein L21  43.86 
 
 		 132 aa  97.8  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000243577  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  46 
 
 		 102 aa  96.7  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  96.7  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  49 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000486349  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1136  50S ribosomal protein L21  42.11 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000463579  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  93.6  9e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  44.44 
 
 		 104 aa  92  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  44.55 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 104 aa  90.9  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2653  ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 102 aa  90.9  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000599107  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  90.1  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  45.45 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000286753  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 102 aa  90.1  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1211  50S ribosomal protein L21  48 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816286  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  46.53 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  42.57 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  42.02 
 
 		 198 aa  89  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1751  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000842566  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  48 
 
 		 102 aa  88.6  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 146 aa  88.2  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  43.56 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  87.8  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1737  50S ribosomal protein L21  48 
 
 		 102 aa  87.8  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000015429  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1704  50S ribosomal protein L21  48 
 
 		 102 aa  87.8  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000276664  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 105 aa  88.2  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  39.82 
 
 		 224 aa  87.8  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  87.4  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  43.43 
 
 		 104 aa  87.4  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  44.55 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  87.4  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  42.16 
 
 		 223 aa  87  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  41.58 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>