More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3072 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 103 aa  202  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2695  50S ribosomal protein L21  70.59 
 
 		 120 aa  144  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2001  50S ribosomal protein L21  71.57 
 
 		 120 aa  142  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536247  normal  0.99837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2670  50S ribosomal protein L21  65.69 
 
 		 123 aa  130  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000122926  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1107  ribosomal protein L21  50 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212125  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1325  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 132 aa  103  8e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000243577  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1136  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 134 aa  103  8e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000463579  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  46.6 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  46.6 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 105 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  100  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 105 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 171 aa  100  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  45.63 
 
 		 103 aa  99.4  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  41.75 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 104 aa  97.4  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  96.7  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3738  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000915025  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000486349  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 104 aa  94.7  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  41.75 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  45.54 
 
 		 105 aa  94.7  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  94.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 124 aa  93.6  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0018  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 131 aa  93.6  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  93.2  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 101 aa  93.6  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1751  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000842566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 102 aa  92.8  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0646  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362263  normal  0.661162 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 102 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>