More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2670 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2670  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 123 aa  248  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000122926  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2001  50S ribosomal protein L21  65.69 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536247  normal  0.99837 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  65.69 
 
 		 103 aa  130  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2695  50S ribosomal protein L21  60.58 
 
 		 120 aa  130  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1107  ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212125  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1325  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000243577  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 101 aa  100  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1136  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 134 aa  100  9e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000463579  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  48 
 
 		 102 aa  97.8  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  48 
 
 		 102 aa  96.7  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  45.45 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  46 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  46.53 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  43.69 
 
 		 258 aa  93.2  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1751  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000842566  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  46 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000486349  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  44.44 
 
 		 104 aa  90.9  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000286753  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  41.18 
 
 		 198 aa  89.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  41.03 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 104 aa  88.2  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  87.8  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  87.8  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  87.4  7e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0646  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362263  normal  0.661162 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  41.41 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 224 aa  85.5  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0497  ribosomal protein L21  46 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  41.58 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  38.61 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  40.59 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  40.52 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0314  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0205  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 100 aa  82.8  0.000000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  42.06 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  37.62 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  40.59 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1704  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000276664  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1737  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000015429  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>