More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0497 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0497  ribosomal protein L21  100 
 
 		 98 aa  187  5.999999999999999e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2653  ribosomal protein L21  66 
 
 		 102 aa  126  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000599107  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  60.2 
 
 		 221 aa  108  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 101 aa  107  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  58 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  52.48 
 
 		 104 aa  103  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  59.6 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  52.04 
 
 		 140 aa  103  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  54.64 
 
 		 188 aa  103  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  54.64 
 
 		 142 aa  103  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  56 
 
 		 101 aa  101  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000486349  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  53.61 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  55.45 
 
 		 258 aa  101  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  100  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  50.5 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 136 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 124 aa  100  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  51 
 
 		 149 aa  100  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 104 aa  100  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 131 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 131 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 105 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  57 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000286753  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  98.6  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 102 aa  99.4  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  98.6  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 105 aa  98.2  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 156 aa  98.2  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  53.47 
 
 		 198 aa  98.2  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  54 
 
 		 102 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 104 aa  97.4  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 104 aa  97.4  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  53 
 
 		 102 aa  96.7  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  56 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  56 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  56 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  54.55 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  50 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  55 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  55 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  55 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  55 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  55 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  55 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  55 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  55 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  51.96 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  49.5 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  53 
 
 		 102 aa  93.6  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl441  50S ribosomal protein L21  55.67 
 
 		 99 aa  93.2  1e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304369  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 171 aa  92.8  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  52.08 
 
 		 99 aa  93.2  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000107304  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  92.8  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  52 
 
 		 102 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  48.51 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  92  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>