More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1452 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  100 
 
 		 103 aa  202  9e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  69.61 
 
 		 102 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  67.96 
 
 		 104 aa  134  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  67.33 
 
 		 102 aa  133  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  63.73 
 
 		 102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  63.73 
 
 		 102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  63.73 
 
 		 102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  63.73 
 
 		 102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  63.73 
 
 		 102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  63.73 
 
 		 102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  63.73 
 
 		 102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  63.73 
 
 		 102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  61.39 
 
 		 103 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  63.37 
 
 		 102 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  63.37 
 
 		 102 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  63.37 
 
 		 102 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  61.76 
 
 		 132 aa  126  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  58.82 
 
 		 103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  58.25 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  56.31 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  120  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  60.19 
 
 		 102 aa  120  8e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 104 aa  117  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 104 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  57.84 
 
 		 114 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 103 aa  114  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  58 
 
 		 99 aa  111  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000107304  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 102 aa  110  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  61.76 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  57.43 
 
 		 104 aa  110  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000286753  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  52.48 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 105 aa  107  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  58.82 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 104 aa  104  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0957  50S ribosomal protein L21P  52 
 
 		 100 aa  105  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000239901  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 146 aa  103  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1737  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 102 aa  100  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000015429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1704  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 102 aa  100  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000276664  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1211  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 102 aa  100  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816286  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf326  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 101 aa  100  6e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.858976  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  53.92 
 
 		 101 aa  100  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  100  8e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  100  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  48.04 
 
 		 103 aa  99.4  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0205  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 100 aa  98.6  3e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  48.51 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl441  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 99 aa  97.4  5e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304369  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  97.1  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  97.1  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  96.7  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  96.7  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1751  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000842566  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0497  ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 98 aa  95.9  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  46.53 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 115 aa  94  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1584  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 108 aa  93.6  7e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1119  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 105 aa  93.6  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  93.6  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  93.6  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  93.6  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0644  ribosomal protein L21  37.76 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.315584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>