More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2583 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 102 aa  200  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  73.53 
 
 		 102 aa  153  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  69.61 
 
 		 102 aa  143  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  68.63 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  68.63 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  64.71 
 
 		 102 aa  134  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  61 
 
 		 102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3195  50S ribosomal protein L21  68.63 
 
 		 102 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  9.73006e-17  unclonable  7.71694e-24 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  63.73 
 
 		 102 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 		 104 aa  120  7e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 		 104 aa  118  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  57.28 
 
 		 103 aa  115  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  52.88 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  114  5e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  56.31 
 
 		 104 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  110  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  110  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 		 103 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  54.9 
 
 		 101 aa  107  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  51 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  107  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  107  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  53.4 
 
 		 103 aa  107  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  51 
 
 		 129 aa  107  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  107  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  106  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  105  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  49.51 
 
 		 223 aa  106  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  51 
 
 		 188 aa  106  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  51.46 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3738  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000915025  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>