More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2551 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 102 aa  200  7e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  61.54 
 
 		 104 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 102 aa  125  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 		 103 aa  120  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  57.84 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  57.43 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 104 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  53.47 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  58.59 
 
 		 99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000107304  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  56.31 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 102 aa  111  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 102 aa  110  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0484  ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 105 aa  110  7.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.239256  normal  0.0811402 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  110  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  49.51 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 102 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 102 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 102 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 102 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 102 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 102 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 102 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 102 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 102 aa  107  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 102 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 102 aa  107  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  107  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  107  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  107  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  57.43 
 
 		 104 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000286753  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 103 aa  106  9.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  105  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4182  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 101 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 104 aa  105  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  51.55 
 
 		 100 aa  104  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  51.02 
 
 		 116 aa  103  7e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4335  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 101 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>