More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4182 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_4182  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 101 aa  198  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4313  50S ribosomal protein L21  98.02 
 
 		 101 aa  194  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4335  50S ribosomal protein L21  98.02 
 
 		 101 aa  194  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4328  50S ribosomal protein L21  84.16 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.665904 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 102 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 101 aa  97.1  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  97.1  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  97.1  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  97.1  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  46.6 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  52.88 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  53.85 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  94.4  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  94.4  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  50.96 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 102 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 		 136 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  92  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 188 aa  90.9  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  49.04 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  46.6 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  52.88 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  46.94 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  53.54 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 102 aa  90.9  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 125 aa  90.5  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 101 aa  90.5  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000486349  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  90.5  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  90.5  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 131 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  45.92 
 
 		 103 aa  90.1  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 104 aa  89.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  44.9 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0957  50S ribosomal protein L21P  52 
 
 		 100 aa  90.1  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000239901  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  48.08 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  47.06 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4210  50S ribosomal protein L21  53.85 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>