More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_14120 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  100 
 
 		 132 aa  262  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  61.76 
 
 		 103 aa  126  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 		 103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  60.58 
 
 		 104 aa  124  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  64.08 
 
 		 102 aa  123  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 		 102 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  61.76 
 
 		 104 aa  121  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  60.78 
 
 		 104 aa  120  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  58.42 
 
 		 105 aa  120  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 103 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 103 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 103 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 102 aa  116  7.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 146 aa  114  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 		 102 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 		 102 aa  114  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 		 102 aa  114  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 		 102 aa  114  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 		 102 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 		 102 aa  114  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  51.82 
 
 		 114 aa  114  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 		 102 aa  114  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 		 102 aa  114  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 		 102 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 		 102 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 		 102 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  61.17 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  49.51 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  52.38 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0957  50S ribosomal protein L21P  57 
 
 		 100 aa  107  4.0000000000000004e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000239901  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  51.92 
 
 		 104 aa  107  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 104 aa  107  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 104 aa  105  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 104 aa  104  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 101 aa  103  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 102 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 105 aa  102  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  100  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  45.63 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  100  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  100  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  100  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  99.4  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  54 
 
 		 99 aa  99.8  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000107304  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 101 aa  98.2  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000486349  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0086  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109341  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1737  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 102 aa  97.8  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000015429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1704  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 102 aa  97.8  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000276664  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  98.2  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1107  ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 134 aa  97.1  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212125  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1211  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 102 aa  96.7  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816286  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  46.09 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  95.9  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 102 aa  95.9  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  48.98 
 
 		 100 aa  95.5  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1008  50S ribosomal protein L21P  44.55 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>