More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1211 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1211  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 102 aa  204  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816286  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1704  50S ribosomal protein L21  94.12 
 
 		 102 aa  175  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000276664  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1737  50S ribosomal protein L21  94.12 
 
 		 102 aa  175  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000015429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  74.51 
 
 		 102 aa  160  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  72.55 
 
 		 102 aa  156  9e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  68.63 
 
 		 102 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  68.63 
 
 		 102 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  68.63 
 
 		 102 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  68.63 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  68.63 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  68.63 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  68.63 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  68.63 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  68.63 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  68.63 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  68.63 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  65.69 
 
 		 102 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  61.39 
 
 		 104 aa  131  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  60.4 
 
 		 104 aa  128  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  59.41 
 
 		 104 aa  125  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000286753  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  57.84 
 
 		 102 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  57.84 
 
 		 149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 102 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  57.43 
 
 		 102 aa  116  7.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  59.8 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  56.73 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 102 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  56.73 
 
 		 104 aa  114  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 156 aa  113  8.999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0957  50S ribosomal protein L21P  57.58 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000239901  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 102 aa  110  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 104 aa  110  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  54.46 
 
 		 105 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0412  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 100 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl441  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 99 aa  107  5e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304369  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 104 aa  107  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 114 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 105 aa  106  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 		 104 aa  106  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0205  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 102 aa  104  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  103  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  48.54 
 
 		 103 aa  103  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  55.56 
 
 		 99 aa  103  8e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000107304  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  103  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  103  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 102 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf326  50S ribosomal protein L21  51 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.858976  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  46.6 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  48.54 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>