More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0205 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0205  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
100 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  57.73 
 
 
99 aa  122  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000107304  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 
102 aa  114  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 
102 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 
102 aa  114  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 
102 aa  114  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 
102 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 
102 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 
102 aa  114  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 
102 aa  114  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 
102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 
102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 
102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 
102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 
115 aa  111  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1119  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 
105 aa  110  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
115 aa  110  5e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  54.9 
 
 
102 aa  110  5e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  54 
 
 
104 aa  108  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000286753  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
102 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0957  50S ribosomal protein L21P  48.96 
 
 
100 aa  107  4.0000000000000004e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000239901  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0412  50S ribosomal protein L21  51 
 
 
100 aa  107  5e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 
102 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  105  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  52 
 
 
104 aa  106  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 
103 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 
103 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  104  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  48.54 
 
 
103 aa  103  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  103  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  52 
 
 
104 aa  103  9e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  48.04 
 
 
103 aa  103  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1584  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
108 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1527  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
108 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  49.5 
 
 
156 aa  103  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  49.51 
 
 
104 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
103 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
103 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 
103 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
103 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  48.04 
 
 
131 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
103 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  101  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  48.51 
 
 
103 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  46.53 
 
 
103 aa  100  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl441  50S ribosomal protein L21  47.96 
 
 
99 aa  101  4e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304369  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 
103 aa  101  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  101  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 
103 aa  101  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
103 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
103 aa  100  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
104 aa  100  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  100  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  100  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  99.4  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
103 aa  99  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1737  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 
102 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000015429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1704  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 
102 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000276664  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  99.4  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  49.02 
 
 
103 aa  99.4  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  49.02 
 
 
103 aa  98.2  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  46 
 
 
104 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  98.2  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  98.2  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  98.2  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  46 
 
 
104 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  46 
 
 
104 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
102 aa  97.8  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  46 
 
 
104 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1211  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
102 aa  97.4  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816286  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  49.5 
 
 
103 aa  97.8  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
103 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  97.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 
103 aa  97.1  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  42.72 
 
 
103 aa  97.1  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  97.1  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  96.7  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  96.7  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1008  50S ribosomal protein L21P  42.16 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012148  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
103 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 
104 aa  96.7  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>