More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0488 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  100 
 
 		 103 aa  205  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  62.14 
 
 		 104 aa  130  7.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 		 104 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  59.41 
 
 		 105 aa  123  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  55.34 
 
 		 103 aa  123  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  60.4 
 
 		 102 aa  122  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  120  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  120  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  57.43 
 
 		 104 aa  120  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  120  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  120  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  59.41 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 103 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 104 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  52.43 
 
 		 104 aa  118  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 103 aa  117  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 102 aa  114  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  112  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  110  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  110  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2001  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536247  normal  0.99837 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 105 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  52.88 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 		 102 aa  107  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 102 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 102 aa  107  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 102 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 102 aa  107  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 102 aa  107  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 102 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 102 aa  107  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 102 aa  107  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 102 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 102 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 102 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  52.43 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>