More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0528 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  100 
 
 		 105 aa  207  5e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  66.34 
 
 		 103 aa  138  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  58.25 
 
 		 104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  62.75 
 
 		 104 aa  131  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  62.14 
 
 		 102 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  62.75 
 
 		 103 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  56.73 
 
 		 104 aa  124  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  59.41 
 
 		 103 aa  123  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  56.31 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  51.49 
 
 		 104 aa  121  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  59.41 
 
 		 114 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 132 aa  120  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  64.36 
 
 		 103 aa  120  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  56.31 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 103 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  52.48 
 
 		 103 aa  116  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  60.4 
 
 		 102 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  60.4 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  59.41 
 
 		 102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  59.41 
 
 		 102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  59.41 
 
 		 102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 103 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  53.06 
 
 		 104 aa  114  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 102 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 102 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 102 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 102 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 102 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 102 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 102 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 102 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  53.47 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  57.43 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  57 
 
 		 99 aa  111  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000107304  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 104 aa  110  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  110  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  110  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  110  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  50.5 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0646  50S ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362263  normal  0.661162 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  57.43 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  107  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  107  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  105  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  105  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  105  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  55 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 102 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  55 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 115 aa  104  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>