More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001673 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  99.03 
 
 		 103 aa  205  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  100 
 
 		 103 aa  206  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  99.03 
 
 		 103 aa  205  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  89.32 
 
 		 103 aa  191  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  79.61 
 
 		 103 aa  179  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  79.61 
 
 		 103 aa  179  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  81.55 
 
 		 103 aa  179  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  79.61 
 
 		 103 aa  179  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  80.58 
 
 		 103 aa  177  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  82.52 
 
 		 103 aa  177  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  81.55 
 
 		 103 aa  174  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  79.61 
 
 		 103 aa  174  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  81.55 
 
 		 103 aa  174  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  79.61 
 
 		 103 aa  173  7e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  79.61 
 
 		 103 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  79.61 
 
 		 103 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  78.64 
 
 		 103 aa  171  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  79.61 
 
 		 103 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  79.61 
 
 		 103 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  79.61 
 
 		 103 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  79.61 
 
 		 103 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  78.64 
 
 		 103 aa  171  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  79.61 
 
 		 103 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  79.61 
 
 		 103 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  79.61 
 
 		 103 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  79.61 
 
 		 103 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  78.64 
 
 		 103 aa  171  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  79.61 
 
 		 103 aa  171  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  78.64 
 
 		 103 aa  170  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  78.64 
 
 		 103 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  78.64 
 
 		 103 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  78.64 
 
 		 103 aa  169  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  78.64 
 
 		 103 aa  169  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  78.64 
 
 		 103 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  78.64 
 
 		 103 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  77.45 
 
 		 103 aa  169  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  78.64 
 
 		 103 aa  169  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  79.61 
 
 		 103 aa  168  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3738  50S ribosomal protein L21  75.73 
 
 		 103 aa  168  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000915025  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  77.67 
 
 		 103 aa  167  6e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  77.67 
 
 		 103 aa  167  6e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  77.67 
 
 		 103 aa  167  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  78.64 
 
 		 103 aa  166  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  77.67 
 
 		 103 aa  166  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  77.67 
 
 		 103 aa  166  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  76.7 
 
 		 103 aa  165  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  76.7 
 
 		 103 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  78.22 
 
 		 103 aa  164  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  74.76 
 
 		 103 aa  163  8e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  73.53 
 
 		 102 aa  160  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  69.9 
 
 		 103 aa  157  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1008  50S ribosomal protein L21P  71.29 
 
 		 103 aa  156  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  67.96 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  65.05 
 
 		 103 aa  147  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  69.61 
 
 		 103 aa  147  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  66.99 
 
 		 103 aa  146  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  65.69 
 
 		 104 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  65.69 
 
 		 104 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  65.69 
 
 		 104 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  64.71 
 
 		 104 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 		 103 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  61.17 
 
 		 103 aa  141  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  60.19 
 
 		 103 aa  140  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  62.38 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  64.08 
 
 		 104 aa  135  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  59.22 
 
 		 103 aa  133  7.000000000000001e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0644  ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 103 aa  133  9.999999999999999e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.315584  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  61.54 
 
 		 104 aa  130  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 		 103 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 		 103 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  58.82 
 
 		 103 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 103 aa  124  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  57.28 
 
 		 104 aa  124  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 104 aa  123  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1584  50S ribosomal protein L21  57.84 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 103 aa  121  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1119  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 105 aa  120  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1527  50S ribosomal protein L21  57.84 
 
 		 108 aa  120  8e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3033  ribosomal protein L21  59.22 
 
 		 104 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 115 aa  117  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  114  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  114  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 102 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 102 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 102 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>