More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4338 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 103 aa  201  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  66.02 
 
 		 114 aa  140  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  63.73 
 
 		 104 aa  140  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  66.99 
 
 		 103 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  66.02 
 
 		 102 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  64.08 
 
 		 103 aa  135  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  64.08 
 
 		 103 aa  135  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  65.05 
 
 		 103 aa  133  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  64.08 
 
 		 102 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  64.08 
 
 		 102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  64.08 
 
 		 102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  64.08 
 
 		 102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 		 102 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 		 102 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 		 102 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 		 102 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 		 102 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 		 102 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 		 102 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 		 102 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  62.75 
 
 		 105 aa  126  8.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  58.25 
 
 		 104 aa  125  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  65.05 
 
 		 102 aa  123  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  58.82 
 
 		 103 aa  123  9e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  59.8 
 
 		 104 aa  121  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 		 102 aa  120  9e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  55.77 
 
 		 104 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  59.8 
 
 		 104 aa  118  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  117  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 102 aa  114  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  52.43 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 103 aa  114  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  57.43 
 
 		 105 aa  113  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  61.17 
 
 		 103 aa  113  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  55.24 
 
 		 101 aa  113  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  53.4 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  51.46 
 
 		 103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 		 102 aa  110  8.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 102 aa  110  9e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0957  50S ribosomal protein L21P  56 
 
 		 100 aa  107  6e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000239901  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0107  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  106  9.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  105  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1704  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000276664  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  105  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1737  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000015429  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  50.96 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  49.51 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1211  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816286  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 104 aa  103  8e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000286753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 102 aa  103  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  103  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4884  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125132  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  52 
 
 		 99 aa  103  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000107304  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1336  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100172  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  47.57 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1350  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0226901  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13981  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 170 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.510472 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1036  50S ribosomal protein L21  48.08 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0850957  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 102 aa  100  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  100  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 102 aa  100  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  100  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  100  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  100  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>