More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3236 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 102 aa  203  8e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  87.25 
 
 		 102 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  84.31 
 
 		 102 aa  174  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  83.33 
 
 		 102 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3195  50S ribosomal protein L21  87.25 
 
 		 102 aa  166  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  9.73006e-17  unclonable  7.71694e-24 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  73.53 
 
 		 102 aa  153  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  70.59 
 
 		 102 aa  147  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  69.61 
 
 		 102 aa  142  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  57.43 
 
 		 102 aa  123  7e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  52.43 
 
 		 223 aa  118  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 		 104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  55.77 
 
 		 104 aa  111  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  55.34 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 102 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 104 aa  110  9e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  107  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  107  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 104 aa  105  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 115 aa  104  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 124 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  103  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  103  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 115 aa  103  7e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  103  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 101 aa  103  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 104 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 104 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 104 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  48 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  48 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 105 aa  100  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  51.49 
 
 		 105 aa  100  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  48 
 
 		 188 aa  100  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  54.9 
 
 		 101 aa  100  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  100  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  100  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  100  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  100  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 114 aa  100  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 102 aa  100  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  50.49 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  99.4  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>