More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4884 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4884  ribosomal protein L21  100 
 
 		 103 aa  205  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125132  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  65.05 
 
 		 208 aa  142  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2481  ribosomal protein L21  73.79 
 
 		 105 aa  135  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726202  normal  0.224153 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 		 224 aa  127  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0107  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 103 aa  118  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1624  ribosomal protein L21  64.36 
 
 		 103 aa  115  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1545  50S ribosomal protein L21  63.37 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0314  50S ribosomal protein L21  56.19 
 
 		 105 aa  110  6e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2047  ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 102 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  44.66 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 102 aa  98.2  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  41.75 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 102 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  48.51 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0646  50S ribosomal protein L21  49 
 
 		 130 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362263  normal  0.661162 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  94.4  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  47.96 
 
 		 100 aa  93.6  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  47.57 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  92.8  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  92  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  90.1  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  90.1  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  90.1  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  90.1  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  90.1  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1113  ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 118 aa  89.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.582987  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0453  50S ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 102 aa  89.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  87.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  47.12 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1751  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000842566  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1211  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 102 aa  86.7  9e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816286  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1737  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000015429  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1704  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000276664  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0839  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.0819000000000001e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 104 aa  84.7  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1350  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0226901  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 102 aa  84  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2001  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 120 aa  84  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536247  normal  0.99837 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 102 aa  84  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 102 aa  84  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 102 aa  84  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 102 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 102 aa  84  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 102 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>