More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0453 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0453  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 102 aa  207  5e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0107  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 103 aa  117  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 208 aa  117  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 224 aa  116  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4884  ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125132  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1545  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1624  ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  45.54 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 171 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2481  ribosomal protein L21  56.73 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726202  normal  0.224153 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 104 aa  92.8  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  45.54 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 102 aa  90.5  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 102 aa  90.5  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  88.6  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  41.18 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  43.56 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 104 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 104 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 104 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 104 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 103 aa  87.4  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 132 aa  87  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1113  ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 118 aa  87  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.582987  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4414  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4877  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 102 aa  87  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 102 aa  86.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2047  ribosomal protein L21  47.12 
 
 		 100 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0314  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0484  ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.239256  normal  0.0811402 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4922  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0179671  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  84.3  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  84.3  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  42.16 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  40.2 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>