More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2250 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 102 aa  208  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  72.28 
 
 		 102 aa  159  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  72.28 
 
 		 102 aa  156  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  68.32 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  56.86 
 
 		 103 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  56.44 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 104 aa  114  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 103 aa  114  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 102 aa  110  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 103 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 103 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 104 aa  108  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 102 aa  107  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  107  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  54 
 
 		 142 aa  107  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  107  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 115 aa  107  6e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3417  ribosomal protein L21  60.78 
 
 		 103 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 115 aa  107  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  54 
 
 		 188 aa  107  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 131 aa  105  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 103 aa  105  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  50 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  53 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 104 aa  104  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 105 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  50 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1211  50S ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816286  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  54 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000486349  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 171 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 102 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  49 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 136 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0497  ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 98 aa  100  5e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>