More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3417 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3417  ribosomal protein L21  100 
 
 
103 aa  205  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  61.17 
 
 
102 aa  133  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  61.17 
 
 
102 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  60.78 
 
 
102 aa  131  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  60.19 
 
 
103 aa  130  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
103 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 
103 aa  124  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  57.28 
 
 
149 aa  123  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  55.34 
 
 
104 aa  122  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  55.88 
 
 
104 aa  120  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  56.73 
 
 
104 aa  120  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
102 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
102 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
102 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
102 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  117  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  117  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
102 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 
104 aa  116  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 
124 aa  114  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
104 aa  114  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  49.51 
 
 
103 aa  113  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  113  8.999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  111  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 
103 aa  112  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 
106 aa  111  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  49.5 
 
 
103 aa  110  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  110  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  50 
 
 
103 aa  110  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  110  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 
103 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  110  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  110  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  110  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 
103 aa  110  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  110  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  51.46 
 
 
103 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  48.54 
 
 
103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  46.6 
 
 
104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  46.53 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
105 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0723214 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  108  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  46.6 
 
 
103 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  108  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  108  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  108  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
105 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
104 aa  107  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>