More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0749 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  100 
 
 
101 aa  197  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000486349  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  83.17 
 
 
101 aa  166  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  110  7.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  50.49 
 
 
103 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  54.46 
 
 
103 aa  106  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 
102 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 
102 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 
102 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  50.5 
 
 
103 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 
102 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 
102 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  51.96 
 
 
102 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  104  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  104  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  104  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  104  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000450477  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  48.54 
 
 
104 aa  104  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
104 aa  104  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  49.51 
 
 
103 aa  103  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  52.48 
 
 
103 aa  103  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  103  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  102  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  102  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 
102 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 
102 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 
102 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 
102 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 
102 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 
102 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  54 
 
 
102 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 
102 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 
102 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0497  ribosomal protein L21  56 
 
 
98 aa  101  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  101  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  101  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  101  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  101  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 
104 aa  101  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3738  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  100  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000915025  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  100  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  100  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  50 
 
 
104 aa  100  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 
105 aa  100  8e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  52 
 
 
102 aa  100  8e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  100  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  47.57 
 
 
103 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  99.4  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  53.47 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  51.46 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  47.57 
 
 
103 aa  99  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  99.4  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
103 aa  98.6  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  50.49 
 
 
132 aa  98.2  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
104 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  47.06 
 
 
103 aa  98.2  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
104 aa  98.2  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
104 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
104 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  50 
 
 
149 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
104 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  97.8  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 
102 aa  97.4  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  97.4  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  55.34 
 
 
198 aa  97.4  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
104 aa  97.1  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 
102 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>