More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3584 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   
<


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
103 aa  206  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  100 
 
 
103 aa  206  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  99.03 
 
 
103 aa  205  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  99.03 
 
 
103 aa  205  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
103 aa  206  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
103 aa  206  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
103 aa  206  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
103 aa  206  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
103 aa  206  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  99.03 
 
 
103 aa  205  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
103 aa  206  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  206  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  98.06 
 
 
103 aa  204  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  99.03 
 
 
103 aa  204  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  93.2 
 
 
103 aa  194  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  92.23 
 
 
103 aa  194  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  88.35 
 
 
103 aa  193  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  88.35 
 
 
103 aa  193  9e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  88.35 
 
 
103 aa  193  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  89.32 
 
 
103 aa  192  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  91.26 
 
 
103 aa  192  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  92.23 
 
 
103 aa  192  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a