More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1850 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 142 aa  274  4e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 188 aa  273  4e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  98.02 
 
 		 129 aa  199  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  59.09 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  71.29 
 
 		 124 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  70.59 
 
 		 104 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  68.63 
 
 		 105 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  67.65 
 
 		 105 aa  140  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3461  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  72.65 
 
 		 230 aa  139  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2589  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  50.68 
 
 		 140 aa  133  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  61.17 
 
 		 221 aa  133  8e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  57.94 
 
 		 223 aa  130  7.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  55.75 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  63.37 
 
 		 125 aa  127  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  59.63 
 
 		 198 aa  127  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  54.87 
 
 		 131 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  63.37 
 
 		 103 aa  125  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  55.05 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  62.11 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  60.4 
 
 		 104 aa  117  7.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0427  50S ribosomal protein L21  63.3 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  54 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0439  50S ribosomal protein L21  52.74 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0514  50S ribosomal protein L21  54.76 
 
 		 128 aa  114  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  53.21 
 
 		 258 aa  114  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  55 
 
 		 102 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0153  50S ribosomal protein L21  59.26 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0589  50S ribosomal protein L21  61.11 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0151  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.772781  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  56.44 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0246  50S ribosomal protein L21  61.11 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4922  50S ribosomal protein L21  60.91 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0179671  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  51 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  54 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4414  50S ribosomal protein L21  60 
 
 		 130 aa  107  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4877  50S ribosomal protein L21  60 
 
 		 130 aa  107  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 104 aa  107  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  49 
 
 		 102 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 104 aa  104  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0497  ribosomal protein L21  54.64 
 
 		 98 aa  104  5e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0108  50S ribosomal protein L21  63.73 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.111218 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4210  50S ribosomal protein L21  63.73 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  54 
 
 		 101 aa  102  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  48 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4723  50S ribosomal protein L21  62.75 
 
 		 105 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 104 aa  100  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  52 
 
 		 102 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  49.5 
 
 		 103 aa  100  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  52 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  48 
 
 		 102 aa  99.4  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 115 aa  99  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  50 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 102 aa  97.8  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 		 106 aa  97.4  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  52 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  43 
 
 		 102 aa  95.9  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2041  50S ribosomal protein L21  56.38 
 
 		 164 aa  94.4  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.214914 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  93.6  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1416  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  92.8  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  42.99 
 
 		 224 aa  92.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  92  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4182  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 101 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0929  50S ribosomal protein L21  52.58 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4328  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 138 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.665904 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1340  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0383215  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  48.51 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2142  ribosomal protein L21  60.61 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>