More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2047 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2047  ribosomal protein L21  100 
 
 		 100 aa  196  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4884  ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125132  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 208 aa  103  8e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 224 aa  98.6  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1624  ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  41.18 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0107  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 124 aa  84.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 188 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1545  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0314  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  35.64 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1525  50S ribosomal protein L21P  37.37 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 157 aa  76.6  0.00000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  42.16 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  41.58 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2481  ribosomal protein L21  49.06 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726202  normal  0.224153 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0484  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.239256  normal  0.0811402 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0701  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.763795  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  37.25 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  35.58 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 156 aa  72  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  72  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  38.1 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  35.92 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2695  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  36.63 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>